项目章一般不可以直接用于进度款相关事务，但具体需分情况讨论：

1. 从印章效力角度
   项目章通常用于项目内部管理、技术文件签署等特定场景，其法律效力范围由公司章程或授权文件明确界定。若公司未明确授权项目章可签署进度款支付文件（如工程款申请单、结算单等），则使用项目章签署此类文件可能因”超越授权范围”被认定为无效，导致付款流程受阻或引发纠纷。

2. 从合同约定角度
   若建设工程施工合同或补充协议中明确约定”进度款支付文件需加盖公司公章或合同专用章”，则项目章不符合合同要求，对方有权拒绝认可。但若合同仅要求”项目负责人签字”或”项目部签章”，且项目章经公司备案授权，则可能被接受——需结合具体合同条款判断。

3. 从实务风险角度
   即使项目章被部分接受，仍存在以下风险：

• 表见代理风险：若相对方有理由相信项目章代表公司意志（如长期使用项目章办理付款），公司可能需承担付款责任；
  
• 内部追责风险：项目人员擅自使用项目章签署付款文件，可能构成越权行为，公司可向责任人追偿；
  
• 文件效力瑕疵：进度款支付文件可能因印章问题被认定为未成立或无效，影响工程款结算。

建议操作：

1. 优先使用公司公章或合同专用章签署进度款文件；
   
2. 若必须使用项目章，需提前取得公司书面授权文件，明确授权范围及期限；
   
3. 在合同中约定”项目章等同于公司公章效力”（需公司特别授权）；
   
4. 保留项目章使用登记记录，避免被滥用。
   

如需进一步分析具体合同条款或印章授权文件，可提供详细信息后为您具体解答。