调休假扣工时费是否合法，需根据具体情况细致分析。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、调休假与工时费的基本概念
调休假，通常指的是劳动者因工作需要，在休息日或法定节假日加班后，用人单位安排其在其他时间进行补休的制度。而工时费，一般可以理解为劳动者因提供劳动而应获得的报酬，这里可以特指加班费，即劳动者在规定工作时间之外提供劳动所获得的额外报酬。
二、调休假与工时费（加班费）的法律规定
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，用人单位在安排劳动者延长工作时间、休息日工作且不能安排补休，以及法定休假日工作时，应当按照相应标准支付高于正常工作时间的工资报酬。这明确了加班费的支付条件和标准，同时也暗示了调休假（即补休）是用人单位在休息日安排劳动者工作后的一种合法补偿方式。
三、调休假扣工时费的合法性分析
一般原则：
- 调休假本身是对劳动者加班的一种补偿方式，其目的在于保障劳动者的休息权。因此，在调休假期间，劳动者不应被扣除任何形式的工时费或加班费。
- 如果用人单位在调休假期间扣除劳动者的工时费，这实际上是对劳动者休息权的侵害，也是违反劳动法规定的。
特殊情况：
- 尽管一般情况下调休假不应扣除工时费，但如果用人单位与劳动者在劳动合同或规章制度中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照约定执行可能是合法的。但这种情况较为罕见，且需要严格的法律程序和公示告知程序。
- 另一种可能是，劳动者在调休假期间实际上并未完全休息，而是从事了其他与工作相关的活动（如远程办公、参加会议等）。在这种情况下，如果用人单位能够证明劳动者确实提供了劳动，并且双方对此有明确约定，那么扣除部分工时费（但应确保不低于法定标准）可能在一定程度上被认定为合法。然而，这种情况需要严格的证据支持和明确的约定。
四、不合法情况及其法律后果
- 如果用人单位在调休假期间无故扣除劳动者的工时费，这将被认定为违法行为。
- 劳动者有权向劳动行政部门投诉，要求用人单位支付被扣除的工时费，并可能获得相应的赔偿。
- 用人单位还可能面临劳动行政部门的警告、责令改正等法律后果。
五、建议与总结
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读关于调休假和工时费的条款，确保自己的权益得到保障。
- 如果发现用人单位在调休假期间扣除工时费，应及时与用人单位沟通协商，必要时向劳动行政部门投诉。
对于用人单位：
- 应严格遵守劳动法的规定，确保劳动者的休息权和劳动报酬权得到保障。
- 在制定规章制度或与劳动者签订劳动合同时，应明确调休假和工时费的相关条款，避免产生不必要的法律纠纷。
总结来说，调休假扣工时费在一般情况下是不合法的。除非双方有明确的约定且该约定不违反法律法规的强制性规定，或者劳动者在调休假期间确实提供了劳动且双方对此有明确约定（但这种情况需要严格的证据支持和明确的约定）。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。