结论前置：公司因员工操作失误罚款1000元是否违法不能一概而论，需分情况讨论。

1. 从罚款的合法性依据角度
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
   若公司罚款1000元后，员工当月工资扣除后低于当地最低工资标准，或扣除比例超过20%，则属于违法行为。例如，员工月工资为4000元，扣除1000元后剩余3000元，若当地最低工资标准为2200元，则扣除合法；但若员工月工资为3000元，扣除1000元后剩余2000元，低于最低工资标准，则违法。

2. 从公司规章制度的合法性角度
   公司罚款需以合法有效的规章制度为依据。若公司规章制度中明确规定了操作失误的罚款标准（如1000元），且该制度经民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）、已向员工公示或告知，则罚款可能合法；但若规章制度未经过民主程序、未公示，或罚款标准明显不合理（如远高于实际损失），则可能因制度违法导致罚款无效。

3. 从罚款与实际损失的关联性角度
   即使公司有合法制度，罚款金额也不得超过员工操作失误造成的实际损失。若公司无法证明1000元罚款与员工失误导致的损失相当（如损失仅为500元，却罚款1000元），则属于违法克扣工资，员工可要求公司返还差额。

建议：

• 若公司罚款符合上述合法条件（如扣除后工资不低于最低标准、制度合法、罚款与损失相当），员工需接受处罚；
  
• 若公司罚款违法，员工可先与公司协商要求返还罚款，协商不成可向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁主张权益。
  

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