公司罚员工一千元，在大多数情况下是违法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与原则：

   • 根据我国法律，对公民的财产行使经济处罚权的主体仅限于法律法规明确授权的行政机关、司法机关等，企业并不具备这一权利。
   • 劳动者与企业之间的关系，主要受劳动法等社会法调整，而非简单的民事合同关系。因此，企业无权随意对员工进行罚款。

2. 公司罚款的合法性分析：

   • 规章制度：即便公司有内部的规章制度，且规定了对员工的罚款措施，但该规章制度必须合法制定，并经过民主程序及向员工公示。若规章制度本身不合法或未履行必要程序，则罚款行为无效。
   • 罚款金额与合理性：罚款金额应当与员工违反规章制度的行为性质、情节以及给公司造成的损失程度相适应。若罚款金额过高，与员工的违规行为明显不成比例，则可能构成对员工财产权的侵犯。

3. 公司对员工处罚的合法措施：

   • 公司对员工进行处罚时，应采取合法且合理的措施，如警告、记过、降职、开除等行政处分，或通过扣除绩效奖金、调整岗位等方式来体现对员工的处罚，而非直接罚款。

4. 员工被公司罚款的处理方式：

   • 若员工遭遇公司非法罚款，应首先了解相关法律法规，明确企业并无直接罚款的权利。
   • 查看公司规章制度，确认是否存在非法罚款的条款，并与公司管理层进行沟通协商。
   • 若沟通无果，员工可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉举报，以维护自己的合法权益。
   • 在整个过程中，员工应注意保留相关证据，如罚款通知、工资单等，以便在需要时提供证明。

综上所述，公司直接罚款员工一千元，在大多数情况下是违法的。公司应采取合法且合理的处罚措施，而员工在遭遇非法罚款时，也应积极维护自己的合法权益。如有进一步的法律问题，欢迎直接向我咨询。