员工与总公司和分公司分别签订合同，在一般情况下，并不直接影响其工作年限的连续计算，但具体情形需结合劳动合同的实际履行情况、法律规定及司法实践来综合判断。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律框架下的工作年限计算
《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动者在同一用人单位连续工作满十年的，有权要求签订无固定期限劳动合同。这里的关键是“同一用人单位”和“连续工作”。
- 当员工与总公司和分公司分别签订劳动合同时，若总公司和分公司具有独立的法人资格，则它们被视为不同的用人单位。在此情况下，员工在总公司和分公司的工作年限通常不能简单合并计算。
工作年限的连续计算原则：
- 工作年限的连续计算通常基于员工在同一用人单位内的连续工作状态。若员工因非本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作，且原用人单位未支付经济补偿，新用人单位在解除或终止劳动合同时计算支付经济补偿的工作年限时，应将原用人单位的工作年限合并计算。但这一原则主要适用于用人单位发生合并、分立等情形，并不直接适用于员工与总公司和分公司分别签订合同的情况。
二、实际操作中的考虑因素
劳动合同的实际履行情况：
- 尽管员工与总公司和分公司分别签订了劳动合同，但如果实际上员工的工作地点、工作内容、管理关系等均未发生实质性变化，且总公司和分公司之间存在关联关系（如分公司是总公司的分支机构），法院或仲裁机构在裁决时可能会考虑这些因素，对工作年限的连续计算作出有利于员工的判断。
公司内部政策与规定：
- 有些公司可能内部有规定，明确员工在总公司和分公司之间调动时工作年限的连续计算方式。这种情况下，应优先遵循公司内部政策与规定。
司法实践中的案例：
- 司法实践中，对于员工与总公司和分公司分别签订合同的工作年限计算问题，存在不同的裁判观点。有些法院可能更倾向于保护劳动者的权益，认为在总公司和分公司之间调动不应影响工作年限的连续计算；而有些法院则可能更严格地遵循法人资格独立的原则，认为工作年限不能合并计算。
三、建议与风险提示
对于员工：
- 在与总公司和分公司签订劳动合同时，应明确询问并了解公司对于工作年限连续计算的政策与规定。
- 如有可能，争取在劳动合同中明确约定工作年限的连续计算方式，以避免未来可能出现的纠纷。
- 如发生纠纷，应及时收集并保留相关证据（如工作记录、工资单、社保缴纳记录等），以便在仲裁或诉讼中维护自己的权益。
对于公司：
- 在制定公司政策与规定时，应明确员工在总公司和分公司之间调动时工作年限的连续计算方式，以避免未来可能出现的法律纠纷。
- 在与员工签订劳动合同时，应就工作年限的连续计算问题与员工进行充分沟通并明确约定。
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