恢复执行标的时，通常是扣除已经执行的部分，而非直接按照原判决书的全额执行。以下是对此问题的详细分析：

一、法律原则与规定

在执行程序中，一旦部分执行完毕，剩余的执行标的应当是原判决书中确定的标的额减去已经执行的部分。这是基于执行程序的效率和公平原则，避免对同一标的进行重复执行，同时也保护了被执行人的合法权益。

二、具体执行流程

1. 执行申请：当申请执行人发现被执行人有可供执行的财产时，可以向法院申请恢复执行。
2. 执行审查：法院在收到恢复执行申请后，会审查被执行人的财产状况以及之前执行的情况。
3. 执行标的确定：在审查过程中，法院会确定剩余的执行标的，即原判决书中确定的标的额减去已经执行的部分。
4. 执行实施：法院根据确定的剩余执行标的，采取相应的执行措施，如查封、扣押、拍卖等，以实现申请执行人的合法权益。

三、特殊情况考虑

1. 执行和解：如果在执行过程中，双方当事人达成了执行和解协议，并且部分履行了和解协议，那么在恢复执行时，应当考虑和解协议的履行情况，对剩余的执行标的进行相应调整。
2. 执行异议：如果被执行人对执行标的提出异议，认为已经执行的部分存在错误或不当，法院在审查异议成立后，可能会对已经执行的部分进行调整，从而影响剩余执行标的的确定。

四、实际操作建议

1. 保留执行证据：申请执行人在执行过程中应当保留好所有与执行相关的证据，如执行裁定书、执行通知书、财产查封/扣押清单等，以便在恢复执行时提供给法院审查。
2. 及时沟通：申请执行人在发现被执行人有可供执行的财产时，应当及时与法院沟通，提交恢复执行申请，并说明之前执行的情况和剩余执行标的的确定依据。
3. 关注执行进展：在恢复执行过程中，申请执行人应当关注执行进展，及时与法院沟通执行中遇到的问题和困难，以便法院能够采取相应的措施加以解决。

总结来说，恢复执行标的时通常是扣除已经执行的部分。在实际操作中，申请执行人应当保留好执行证据，及时与法院沟通，并关注执行进展。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。