在达成执行和解协议后，如果一方不履行该协议，另一方申请恢复执行时，原则上应按照原生效法律文书（即判决书）执行，但执行和解协议中已经履行的部分应当扣除。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据与原则
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，在执行过程中，双方当事人可以自行达成和解协议。如果一方不履行或者不完全履行在执行中双方自愿达成的和解协议，对方当事人申请执行原生效法律文书的，人民法院应当恢复执行。这意味着，恢复执行时，执行依据是原生效法律文书，而非执行和解协议。
执行和解协议的效力与影响
未履行部分的执行：由于执行和解协议并未改变原生效法律文书的效力，因此当一方不履行和解协议时，另一方有权申请恢复执行原生效法律文书。此时，法院将依据原判决的内容进行执行，包括但不限于金钱给付、行为履行等。
已履行部分的扣除：在恢复执行时，如果执行和解协议中已经履行了部分义务，这部分履行应当从原生效法律文书的执行标的中扣除。例如，如果原判决要求被告支付10万元，而执行和解协议中双方约定被告先支付5万元，剩余部分分期支付。如果被告支付了5万元后不再履行，那么恢复执行时，法院将只执行剩余的5万元。
实际操作中的注意事项
申请恢复执行的程序：当一方不履行执行和解协议时，另一方需要向法院提交书面申请，请求恢复执行原生效法律文书。申请时，应附上原生效法律文书的副本、执行和解协议的副本以及证明对方未履行和解协议的相关证据。
法院的审查与决定：法院在收到恢复执行的申请后，会进行审查。如果确认对方确实未履行执行和解协议，且申请符合法律规定，法院将作出恢复执行的裁定，并开始执行程序。
执行过程中的变通与协商：在恢复执行后，双方当事人仍然可以就执行事宜进行协商。如果双方能够达成新的和解协议，并经法院确认，那么执行程序可以按照新的和解协议进行。
示例说明
假设甲与乙之间发生了一起交通事故纠纷，法院判决乙赔偿甲10万元。在执行过程中，双方达成了执行和解协议，约定乙先支付5万元，剩余5万元在一年内付清。然而，乙在支付了5万元后，剩余部分一直未支付。此时，甲有权向法院申请恢复执行原生效法律文书，即要求乙支付剩余的5万元。法院在审查确认后，将作出恢复执行的裁定，并执行剩余的5万元。
综上所述，达成执行和解协议后不履行，申请恢复执行时原则上应按照原生效法律文书执行，但已履行的部分应当扣除。如果您在执行过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。