医务人员收受五千元回扣，属于违法行为，将面临行政处罚，情节严重还可能涉及刑事犯罪，同时所在医疗机构也会对其作出相应处理。以下从不同角度展开说明：
行政处罚角度
根据《中华人民共和国医师法》第五十六条规定，医师在执业活动中利用职务之便，索取、非法收受患者财物或者牟取其他不正当利益的，由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令改正，给予警告，没收违法所得，并处一万元以上三万元以下的罚款；情节严重的，责令暂停六个月以上一年以下执业活动直至吊销医师执业证书。
对于收受五千元回扣的医务人员，卫生健康主管部门会依据上述规定进行处罚，先责令其改正违法行为，将收受的五千元回扣予以没收，同时给予警告处分，并处一万元以上三万元以下的罚款。
刑事犯罪角度
如果医务人员收受回扣的行为情节严重，可能构成非国家工作人员受贿罪。根据《中华人民共和国刑法》第一百六十三条规定，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
虽然五千元尚未达到该罪“数额较大”（一般六万元以上）的立案标准，但如果存在多次收受回扣、给单位造成重大损失等情节，也可能被认定为“其他严重情节”而追究刑事责任。此外，如果医务人员属于国家工作人员，如公立医院中具有国家工作人员身份的医生，收受回扣还可能构成受贿罪，受贿罪的立案标准更低（一般三万元以上，特定情形下一万元以上），五千元虽未达一般标准，但有特定情节时同样可能被追责。
医疗机构处理角度
医疗机构作为医务人员的管理单位，会根据内部规章制度对收受回扣的医务人员进行处理。常见的处理方式包括：
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