收受药品回扣5000元属于违法行为，可能面临行政处罚和刑事责任，具体处理方式需结合情节严重程度判断。以下是详细分析：

1. 行政责任层面
   根据《中华人民共和国药品管理法》第一百四十二条，医疗机构工作人员收受回扣的，由卫生健康主管部门或本单位给予处分，没收违法所得，并处一万元以上三万元以下罚款。即使回扣金额为5000元，仍可能被认定为违法行为，面临行政处罚。若行为发生在医疗机构内部，单位可能依据内部规章制度（如《医疗机构工作人员廉洁从业九项准则》）进行额外处分，如警告、记过、解聘等。

2. 刑事责任层面
   若回扣行为符合《中华人民共和国刑法》第一百六十三条规定的“非国家工作人员受贿罪”构成要件，即利用职务便利索取或收受他人财物，为他人谋取利益，且数额较大（司法解释中“数额较大”通常为6万元以上），则可能被追究刑事责任。5000元未达到刑事立案标准，但需注意以下风险：

   • 若存在多次收受、向多人索贿、造成严重后果等情节，可能被认定为“情节严重”，即使未达6万元也可能被追责；
     
   • 若行为人具有国家工作人员身份（如公立医院医生属于事业单位工作人员），则可能构成“受贿罪”，立案标准更低（3万元以上），5000元虽未达标准，但若存在其他恶劣情节仍可能被处理。

3. 实务建议

   • 立即停止行为：若尚未被查处，应主动退还回扣并终止相关合作，避免情节恶化；
     
   • 配合调查：若已被监管部门或单位调查，需如实说明情况，避免隐瞒或伪造证据；
     
   • 法律救济：若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼；若涉嫌犯罪，应尽快委托律师介入，争取从轻处理（如自首、立功、认罪认罚等）。

特别提醒：医疗行业反腐力度持续加强，2023年国家卫健委等14部门联合印发《2023年纠正医药购销领域和医疗服务中不正之风工作要点》，明确严查“红包”、回扣等行为。即使金额较小，也可能因行业特殊性被从严处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体应对方案。