医院收受药品回扣属于严重的违法违规行为，涉及商业贿赂和不正当竞争，同时也可能触犯刑法中的相关条款。以下是针对这一问题的详细处理方式和法律分析：

1. 法律定性
   根据《中华人民共和国刑法》第一百六十四条，对非国家工作人员行贿罪和非国家工作人员受贿罪明确规定：

   • 若医院工作人员（如医生、采购人员）利用职务便利收受回扣，可能构成非国家工作人员受贿罪，最高可处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金或没收财产。
     
   • 若药企或销售人员向医院工作人员行贿，可能构成对非国家工作人员行贿罪，最高可处十年有期徒刑，并处罚金。
     此外，若医院属于公立医院，相关人员可能涉及受贿罪（国家工作人员受贿），处罚更为严厉。

2. 处理流程

   • 内部调查：医院应立即启动内部调查，核实回扣事实，固定证据（如财务记录、沟通记录、证人证言等），并暂停涉事人员职务。
     
   • 行政处罚：卫生健康行政部门可依据《医疗机构从业人员行为规范》等规定，对医院及涉事人员作出警告、罚款、吊销执业资格等处罚。
     
   • 刑事报案：若涉嫌犯罪，医院或监管部门应向公安机关报案，由司法机关立案侦查。
     
   • 民事赔偿：医院可能需向患者或第三方承担民事赔偿责任（如因回扣导致药品质量或价格问题）。

3. 合规建议

   • 完善制度：建立药品采购透明机制，实行集中招标、阳光采购，杜绝暗箱操作。
     
   • 加强培训：定期对医务人员进行廉洁从业和法律风险培训，强化合规意识。
     
   • 监督举报：设立内部举报渠道，对举报人保护并奖励，形成有效监督。
     
   • 法律审查：定期审查合作药企的合规性，避免与有行贿记录的企业合作。

4. 典型案例参考
   某三甲医院药剂科主任因收受药企回扣被判刑6年，医院被罚款500万元，并需退还全部违法所得。此案凸显了法律对医疗领域腐败的零容忍态度。

总结：医院收受药品回扣需从刑事、行政、民事多维度处理，核心是固定证据、配合调查、主动整改。若您或您的机构涉及此类问题，可进一步向我咨询具体应对策略。