结论：员工仲裁赢了，但公司账户上没有钱，员工是可以申请查公司账的，但需遵循一定的法律程序和规定。

详细分析：

1. 申请执行与财产调查：

   • 当员工在劳动仲裁中获胜，且公司未履行裁决时，员工可以向法院申请强制执行。
   • 在执行过程中，法院有权对公司的财产进行调查，这包括但不限于银行账户、房产、车辆等。
   • 如果公司账户上没有钱，法院可以进一步调查公司是否有其他财产可供执行。

2. 申请查公司账的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，执行过程中，当事人有权向法院提供被执行人财产线索，并申请法院进行调查。
   • 虽然直接“查公司账”可能并非法律条文的直接表述，但员工可以通过申请法院执行，并借助法院的力量来调查公司的财产状况，包括银行账户的流水等，以确定公司是否有隐藏或转移的财产。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 员工在申请查公司账时，应尽可能提供具体的财产线索，如公司可能的银行账户、房产信息等，以便法院更有效地进行调查。
   • 如果公司确实没有可供执行的财产，员工可能需要考虑其他执行措施，如申请将公司列入失信被执行人名单、限制公司高消费等，以对公司施加压力，促使其履行裁决。
   • 在某些情况下，如果公司存在恶意逃避执行的行为，员工还可以考虑向公安机关报案，追究公司的刑事责任。

4. 可能的法律后果：

   • 如果法院调查后发现公司确实没有财产可供执行，且员工无法提供其他有效的财产线索，那么执行程序可能会暂时中止或终结。但这并不意味着员工永远无法获得赔偿，如果未来公司有了可供执行的财产，员工可以再次申请恢复执行。
   • 如果公司存在隐藏、转移财产等逃避执行的行为，一旦被发现，法院可以对其采取罚款、拘留等强制措施，甚至追究其刑事责任。

建议：

• 员工在申请查公司账前，应尽可能收集公司的财产线索，以便法院更有效地进行调查。
• 如果对执行程序或相关法律问题有疑问，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供更详细的法律建议和指导。