如果政府规范文件明确要求凭证需要回收，但行政机关否认已经回收，你可以从以下几个角度来处理这个问题：

1. 核实文件要求与回收流程：

   • 首先，你需要仔细查阅相关的政府规范文件，确认文件中是否确实明确规定了凭证的回收要求，以及具体的回收流程和责任主体。
   • 如果文件中有明确规定，你可以要求行政机关提供回收凭证的记录或证明，以验证其是否按照文件要求执行了回收程序。

2. 收集证据以支持你的主张：

   • 如果你认为行政机关未按照文件要求回收凭证，你需要收集相关证据来支持你的主张。这可能包括但不限于：凭证的原件或复印件、与行政机关的沟通记录（如邮件、信函、电话记录等）、目击者证言等。
   • 证据的收集应尽可能全面、客观，并能够形成完整的证据链，以证明行政机关未履行回收义务。

3. 与行政机关进行沟通协商：

   • 在收集到足够证据后，你可以尝试与行政机关进行沟通协商，明确表达你的诉求和依据，要求行政机关承认未回收凭证的事实，并采取相应的补救措施。
   • 沟通协商过程中，保持冷静、理性，避免情绪化表达，以增加解决问题的可能性。

4. 寻求法律救济途径：

   • 如果与行政机关的沟通协商无果，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这可能包括向行政机关的上级部门投诉、申请行政复议或提起行政诉讼等。
   • 在选择法律救济途径时，你需要根据具体情况和法律规定来做出决策，并准备好相应的法律文件和证据材料。

5. 关注后续影响与风险防范：

   • 无论最终处理结果如何，你都需要关注此事可能对你产生的后续影响，如凭证的再次使用、相关权益的保障等。
   • 同时，你也需要从中吸取教训，加强风险防范意识，避免类似情况再次发生。例如，在未来的交易或合作中，可以要求对方提供明确的凭证回收承诺或相关证明文件。

在处理此类问题时，你还需要注意以下几点：

• 保持冷静与理性：面对行政机关的否认或推诿，保持冷静与理性至关重要。避免情绪化表达或采取过激行为，以免加剧矛盾或影响问题的解决。
• 及时咨询专业律师：如果你对法律程序或证据收集等方面存在疑问或不确定，及时咨询专业律师是非常必要的。律师可以提供专业的法律意见和帮助，确保你的权益得到充分保障。

最后，我想强调的是，每个具体案件都有其独特性和复杂性，因此上述建议仅供参考。在实际操作中，你需要根据具体情况和法律规定来灵活应对和处理。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。