结论：工资4000扣了480是否合法，不能一概而论，需要看扣除的具体项目和比例是否符合法律规定。
分析：
扣除项目合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位可以从劳动者工资中扣除的项目主要包括：个人所得税、社会保险费用（包括养老保险、医疗保险、失业保险等）、住房公积金，以及根据法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费，和法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
- 如果扣除的480元属于上述合法扣除项目，那么这种扣除是合法的。
扣除比例限制：
- 即使扣除项目合法，也需要考虑扣除比例是否合法。例如，社会保险费用和住房公积金的扣除比例通常有明确的法律规定，用人单位不得随意提高。
- 对于个人所得税，根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，工资、薪金所得适用超额累进税率，具体税额根据应纳税所得额计算。因此，如果扣除的480元中包含个人所得税，需要核实计算是否正确。
- 若扣除项目为社保等合法项目，且总扣除比例未超过法定上限（一般不超过工资的20%，具体比例因地区和政策而异），则扣除合法。以社保为例，若当地规定个人需承担社保总费用的12%，则4000元工资中社保扣除额应为480元（4000×12%），此时扣除合法。
其他非法扣除情况：
- 如果用人单位以罚款、赔偿等名义从劳动者工资中扣除费用，且这些扣除没有法律依据或未经劳动者同意，那么这种扣除是违法的。
- 若扣除的480元包含非法项目（如未经同意的罚款、赔偿等），或合法项目扣除比例超标，则扣除不合法。例如，若用人单位以“工作失误罚款”名义扣除200元，且无法提供合法依据，则该部分扣除违法。
建议：
- 如果你对扣除的480元有疑问，首先要求用人单位提供详细的扣除明细和依据。
- 如果确认扣除项目或比例不合法，你可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在处理此类问题时，建议保留好相关证据，如工资条、扣除明细等，以便在需要时提供证明。
示例计算（以社保扣除为例）：
- 假设当地规定个人需承担社保总费用的12%，则4000元工资中社保扣除额计算如下：
- 社保扣除额 = 工资 × 社保扣除比例 = 4000 × 12% = 480元
- 若实际扣除的社保费用与此计算结果相符，且没有其他非法扣除项目，则扣除合法。
总之，工资4000扣了480是否合法，需要具体分析扣除的项目和比例。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。