结论：小产权房屋父亲赠与儿子，仅签订赠与协议在法律上存在一定风险，且该协议的效力及后续处理需结合小产权房的特殊性质来综合判断。以下从多个角度为你详细分析：
一、小产权房的特殊性
小产权房通常是指在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，亦称“乡产权房”。由于小产权房没有国家认可的合法产权，在法律上存在诸多限制和风险。
二、赠与协议的法律效力
协议本身的合法性：
- 从合同法的角度来看，赠与协议是双方真实意思表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的，原则上具有法律效力。然而，由于小产权房的产权不完整，赠与协议可能因标的物的违法性而受到影响。
- 如果赠与协议的内容涉及非法转让集体土地使用权等违法行为，那么该协议可能被认定为无效。
协议的形式要求：
- 虽然法律未强制要求赠与合同必须采用书面形式，但鉴于房屋是不动产，且小产权房的特殊性，建议采用书面形式签订赠与协议，以明确双方的权利和义务，避免未来纠纷。
三、赠与后的产权变更问题
无法办理正规过户手续：
- 由于小产权房没有国家认可的合法产权，因此无法像正规商品房一样办理房产过户手续。这意味着，即使签订了赠与协议，儿子也无法获得法律意义上的房屋所有权。
潜在的法律风险：
- 赠与后，如果父亲反悔或出现其他纠纷，儿子可能难以通过法律途径维护自己的权益。因为小产权房的产权不完整，法院在处理相关纠纷时可能面临诸多困难。
- 如果小产权房涉及拆迁、补偿等问题，儿子可能因无法证明自己的产权而遭受损失。
四、法律建议
谨慎考虑赠与行为：
- 在决定赠与小产权房之前，父亲应充分考虑赠与行为的法律后果和潜在风险。如果可能的话，建议咨询专业律师的意见，以评估赠与行为的合法性和可行性。
完善赠与协议内容：
- 如果决定赠与，应确保赠与协议的内容详尽、明确，包括双方的基本信息、赠与房屋的具体描述、赠与意愿与接受、权利与义务、违约责任等条款。同时，可以考虑对协议进行公证以增强其法律效力。
关注政策变化：
- 由于小产权房的政策环境可能随时发生变化，因此赠与双方应密切关注相关政策动态，以便及时调整自己的策略。
考虑其他替代方案：
- 如果可能的话，父亲可以考虑将小产权房出售给有购买意愿的第三方（在符合当地政策的前提下），然后将所得款项赠与儿子。这样既可以避免赠与小产权房带来的法律风险，又可以确保儿子的经济利益。
总结：小产权房屋父亲赠与儿子仅签订赠与协议存在法律风险，且无法办理正规过户手续。在决定赠与之前，建议充分考虑赠与行为的法律后果和潜在风险，并咨询专业律师的意见。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。