护士发生不良事件后，医疗机构对其进行罚钱是否合法，需分情况讨论：

1. 若罚钱行为基于合法有效的规章制度，且符合法定程序：

   • 医疗机构作为用人单位，有权根据内部规章制度对员工进行管理。若这些规章制度是依法制定的，且经过了民主程序（如职工代表大会讨论、公示等），同时罚钱的内容（如罚款金额、罚款事由）不违反法律法规的强制性规定，那么医疗机构对护士因不良事件进行罚钱，可以视为合法的管理行为。
   • 法律依据：虽然直接的法律法规可能并未明确提及“护士不良事件罚钱”，但根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位可以依法制定规章制度，并依据规章制度对员工进行管理。同时，罚款作为一种管理手段，在不超过合理限度且符合法定程序的情况下，是被允许的。不过，值得注意的是，现行法律并未明确赋予用人单位对员工的罚款权，实践中更多是通过绩效扣减、奖金调整等方式进行管理。若医疗机构以罚款名义直接扣减护士工资，可能涉及违法扣除劳动报酬的问题。

2. 若罚钱行为缺乏合法依据或违反法定程序：

   • 如果医疗机构对护士的罚钱行为没有明确的规章制度依据，或者规章制度本身违法（如未经民主程序制定、内容违反法律法规等），又或者罚钱行为违反了法定程序（如未告知护士罚款事由、未给予护士申辩机会等），那么这种罚钱行为就是违法的。
   • 法律后果：护士有权向劳动监察部门投诉，要求医疗机构纠正违法行为，并可能获得相应的赔偿。同时，如果罚钱行为给护士造成了名誉损害或其他精神损害，护士还可以考虑通过法律途径追究医疗机构的民事责任。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 如果护士的不良事件构成了医疗事故或医疗损害，且护士存在过错，那么医疗机构在追究护士责任时，应依据相关法律法规和规章制度进行，而不是简单地罚钱。例如，医疗机构可以根据《医疗纠纷预防和处理条例》等相关规定，对护士进行警告、记过、降级、撤职等处分，或者通过内部调解、第三方调解等方式解决纠纷。
   • 建议：对于医疗机构而言，应建立健全内部管理制度，明确不良事件的处理流程和责任追究机制，确保处理行为的合法性和合理性。对于护士而言，应增强责任心和职业操守，严格遵守诊疗规范和操作流程，避免不良事件的发生。同时，在面对罚钱等处理行为时，应了解自己的合法权益和维权途径，必要时寻求法律帮助。

总结来说，护士发生不良事件后，医疗机构对其进行罚钱是否合法，取决于罚钱行为是否有合法有效的规章制度依据、是否符合法定程序以及是否超过了合理限度。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。