结论：联营协议中，若甲方有负债官司，联营的乙方确实可能面临一定的风险，但具体风险程度及类型需根据联营协议的具体内容、负债的性质及金额、联营项目的运营情况等多种因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
合同相对性原则下的风险隔离：
- 一般原则：根据合同法的相对性原则，联营协议是甲方和乙方之间的约定，原则上仅对双方具有约束力。若甲方的负债官司与其个人财产或业务相关，且未涉及联营项目或联营资产，那么乙方的直接风险可能相对较小。
- 例外情况：然而，如果联营协议中存在对甲方负债的特别约定，如甲方需以其联营份额或联营收益承担个人债务，或者联营项目本身与甲方的负债有直接关联（如联营项目是甲方负债的担保物），那么乙方就可能面临直接的风险。
联营项目运营中的连带风险：
- 运营资金影响：若甲方的负债官司导致其资金紧张，可能影响联营项目的正常运营，如无法按时投入资金、支付供应商款项等，进而影响乙方的收益。
- 信誉风险：甲方的负债官司可能损害其商业信誉，进而影响联营项目的市场声誉和客户信任度，对乙方的长期利益造成损害。
法律程序中的潜在风险：
- 资产查封与执行：若甲方的负债官司导致其财产被查封或执行，且联营项目或联营资产被认定为甲方的可执行财产，那么乙方的联营权益就可能受到侵害。
- 诉讼参与：在极端情况下，乙方可能因联营关系而被卷入甲方的负债官司中，作为第三人参与诉讼，增加乙方的诉讼成本和风险。
风险防范建议：
- 尽职调查：在签订联营协议前，乙方应对甲方进行充分的尽职调查，了解其财务状况、负债情况、商业信誉等，以评估潜在风险。
- 合同条款设计：在联营协议中明确约定双方的权利义务、风险分担机制、违约责任等，特别是针对甲方负债情况的处理方式，以降低乙方的风险。
- 风险隔离措施：考虑采取风险隔离措施，如设立独立的联营实体、将联营资产与甲方个人资产分离等，以保护乙方的联营权益。
- 持续监控与应对：在联营项目运营过程中，乙方应持续监控甲方的财务状况和负债情况，一旦发现潜在风险，及时采取措施应对，如要求甲方提供担保、调整联营策略等。
总结与启示：联营协议中甲方有负债官司确实可能给乙方带来风险，但通过充分的尽职调查、合理的合同条款设计、有效的风险隔离措施以及持续的监控与应对，乙方可以最大限度地降低这些风险。如果您在联营协议签订或履行过程中遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。