针对您提出的“三方协议网签通过了没有盖章是否有效”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确三方协议的法律性质。三方协议，通常涉及三个主体之间的权利和义务关系，其法律效力主要取决于协议的内容是否合法、各方是否真实意思表示以及是否符合相关法律法规的规定。在网签的情况下，虽然形式上可能没有传统的纸质盖章，但电子签名或数字认证等方式在法律上也是被认可的，只要这些方式符合电子签名法等相关法律法规的要求。

接下来，我们分析盖章在协议中的法律作用。盖章，作为传统纸质协议中的一种确认方式，主要起到证明协议真实性和合法性的作用。然而，在网签过程中，由于采用了电子签名或数字认证等先进技术，这些方式同样能够起到确认协议真实性和合法性的作用，且往往更加便捷和高效。

现在，我们回到您的问题本身。如果三方协议已经通过网签方式完成，且各方均使用了符合法律要求的电子签名或数字认证方式进行了确认，那么即使没有传统的纸质盖章，该协议在法律上仍然是有效的。因为网签过程本身已经确保了协议的真实性和合法性，且各方均已经表达了真实的意思表示。

但是，如果网签过程中存在任何瑕疵，比如电子签名不符合法律要求、数字认证过程存在问题或者协议内容本身存在违法之处等，那么该协议可能会被视为无效或存在法律风险。

因此，对于您的问题，我们可以得出以下结论：三方协议网签通过了，如果没有采用符合法律要求的电子签名或数字认证方式进行确认，或者网签过程存在其他瑕疵，那么没有盖章可能会影响协议的法律效力；但如果已经采用了符合法律要求的确认方式，且网签过程无瑕疵，那么即使没有盖章，该协议在法律上仍然是有效的。

为了确保协议的法律效力，建议您在网签过程中严格遵守相关法律法规的要求，采用符合法律规定的电子签名或数字认证方式进行确认，并确保协议内容合法、真实、完整。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请咨询专业律师或相关法律机构。