公司之间协议仅盖章未签字，在多数情况下仍然有效，但具体效力需结合协议内容、双方行为及法律规定综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议效力的基本判断

1. 盖章的法律意义：

   • 盖章是公司表达意思表示的一种方式，具有法律效力。在商业实践中，公司公章被视为公司意志的象征，加盖公章通常意味着公司对协议内容的认可和接受。

2. 签字与盖章的关系：

   • 签字和盖章并非必须同时具备才使协议生效。根据《民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。但并未规定必须同时签字和盖章，因此，仅盖章未签字，在符合其他生效条件的情况下，协议仍然可以成立并生效。

二、协议生效的具体条件

1. 双方意思表示真实：

   • 协议双方必须基于真实的意思表示订立协议，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在盖章时受到欺诈或胁迫，那么该协议可能因意思表示不真实而无效。

2. 协议内容合法合规：

   • 协议内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗。如果协议内容违法或违背公序良俗，那么该协议将自始无效。

3. 协议形式符合要求：

   • 虽然签字并非协议生效的必备条件，但协议的形式仍然需要符合法律法规的要求。例如，某些特定类型的协议可能需要采用书面形式，并加盖公章或合同专用章等。

三、仅盖章未签字协议的特殊情况

1. 公司内部规定或行业惯例：

   • 有些公司内部可能规定，协议必须经法定代表人或授权代表签字并加盖公章才生效。如果公司内部有此类规定，而协议仅盖章未签字，则可能因不符合公司内部规定而影响其效力。此外，某些行业可能存在特定的惯例或要求，也需要考虑在内。

2. 协议履行情况：

   • 如果协议双方已经按照协议内容实际履行了各自的权利和义务，且没有提出异议，那么即使协议仅盖章未签字，也可能被视为双方对协议内容的认可和接受，从而具有法律效力。

四、法律建议

1. 完善协议签署流程：

   • 为了避免因签字盖章问题引发的纠纷，建议公司在订立协议时，明确规定签字和盖章的具体要求，并确保协议双方按照要求执行。

2. 保留相关证据：

   • 在协议订立和履行过程中，建议公司保留好与协议相关的所有证据，如邮件、短信、微信聊天记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。

3. 及时咨询专业律师：

   • 如果公司对协议的效力存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体、更专业的法律建议。

总结来说，公司之间协议仅盖章未签字，在多数情况下仍然有效，但具体效力需结合协议内容、双方行为及法律规定综合判断。为了确保协议的合法性和有效性，建议公司在订立协议时遵循相关法律法规和公司内部规定，并保留好相关证据。如有任何疑问或担忧，请随时向我咨询。