若要起诉“小三”并调取其流水记录，需分步骤进行，且需注意法律程序和证据规则的严格限制，具体如下：

一、明确起诉的法律依据和目的

1. 法律依据：在中国法律体系中，直接起诉“小三”通常不构成独立的民事或刑事案件类型。若要以法律手段追究“小三”的责任，一般需基于其具体行为是否侵犯了你的合法权益，如财产权、名誉权等。例如，若“小三”与你的配偶存在不正当关系，并共同侵占了你的财产（如夫妻共同财产），则你可以基于侵权或夫妻共同财产保护等法律原则提起诉讼。
2. 起诉目的：需明确起诉的具体目的，是要求返还财产、赔偿损失，还是其他。这将直接影响后续的法律程序和证据收集。

二、调取流水记录的合法途径

1. 申请法院调查令：在民事诉讼中，若你需要调取“小三”的银行流水记录作为证据，可以向法院提出申请，由法院出具调查令，要求银行提供相关记录。这通常需要你提供初步的证据证明“小三”与案件有关联，且流水记录对于证明案件事实具有必要性。
2. 律师调查取证：作为你的代理人，律师在符合法律规定的情况下，也可以向法院申请调查取证，包括调取银行流水记录。律师需提交书面申请，并附上相关证据材料，以证明调取流水记录的合法性和必要性。
3. 注意隐私保护：在调取流水记录的过程中，需严格遵守隐私保护的法律原则。不得非法获取、使用或泄露他人的银行流水信息，否则可能面临法律责任。

三、起诉流程

1. 准备起诉材料：包括起诉状、证据材料（如初步证明“小三”与案件有关联的证据、财产侵占的证据等）、身份证明等。
2. 提交法院：将起诉材料提交至有管辖权的法院，并缴纳诉讼费用。
3. 等待法院受理：法院将对起诉材料进行审查，符合受理条件的将予以受理，并通知双方当事人。
4. 参与诉讼程序：包括庭前准备、开庭审理、调解或判决等阶段。在诉讼过程中，你可以提出调取流水记录的申请，并说明其对于证明案件事实的重要性。

四、注意事项

1. 证据充分性：在起诉前，需确保收集到足够的证据来支持你的主张。这包括证明“小三”与你的配偶存在不正当关系的证据、财产侵占的证据等。流水记录只是其中的一部分证据，需与其他证据相互印证。
2. 法律程序合规性：在起诉和调取流水记录的过程中，需严格遵守法律程序的规定。不得采取非法手段获取证据或侵犯他人的合法权益。
3. 寻求专业帮助：由于法律程序复杂且涉及专业法律知识，建议你在起诉前咨询专业律师的意见，以确保你的权益得到充分保护。