若企业未对综合工时制进行报备，员工主张加班费的，一般按标准工时制计算加班费，具体计算方式如下：

1. 未报备综合工时制的法律后果
   根据《劳动法》第三十九条及《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》，企业实行综合工时制需经劳动行政部门审批。若未报备，即使劳动合同或规章制度中约定了综合工时制，该约定也可能因违反法律强制性规定而被认定无效，员工的工作时间仍按标准工时制（每日8小时、每周40小时）计算。

2. 加班费的计算规则

   • 工作日加班：若员工每日工作时间超过8小时，超出部分按不低于工资的150%支付加班费。
     
   • 休息日加班：若员工在周六、日工作且无法安排补休，按不低于工资的200%支付加班费。
     
   • 法定节假日加班：若员工在法定节假日工作，按不低于工资的300%支付加班费。
     

3. 举证责任与证据收集
   员工需证明存在加班事实，可通过以下证据支持主张：

   • 考勤记录（如打卡记录、签到表）；
     
   • 加班通知或工作安排记录（如微信、邮件、短信）；
     
   • 同事证言（需与其他证据相互印证）；
     
   • 工资条（若未显示加班费支付记录，可佐证未支付事实）。
     

4. 企业可能的抗辩与应对
   企业可能主张已支付加班费或实行弹性工作制，但需提供充分证据（如工资条注明加班费项目、员工签字确认的考勤表等）。若企业无法证明，法院或仲裁机构将支持员工的加班费主张。

建议：若您遇到此类纠纷，可先与企业协商补发加班费；若协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如有具体证据或细节需要分析，欢迎直接向我咨询。