供应商对磋商文件有疑问的提出时间，主要依据相关法律法规来确定，具体如下：

1. 《中华人民共和国政府采购法》及相关条例的规定：

   • 供应商若认为采购文件、采购过程或中标结果损害其权益，可在知道或应知其权益受损之日起7个工作日内，以书面形式向采购人或采购代理机构提出质疑。
   • “知道或应知”的具体时间点，对于已依法获取采购文件的潜在供应商而言，是获取采购文件之日；对于未依法获取的供应商，则是采购文件公告期限届满之日。

2. 《中华人民共和国招标投标法实施条例》的规定（若磋商文件属于招标文件范畴）：

   • 供应商对招标文件有异议的，应在投标截止时间10日前提出。
   • 招标人需在收到异议后3日内作出答复，并在此期间暂停招标投标活动。

实际应用中的注意事项：

• 时间点的确定：供应商应准确计算“知道或应知权益受损之日”或“投标截止时间”，以确保在规定时间内提出质疑。例如，若采购文件公告期限为5个工作日，供应商在公告期限内获取了文件并发现问题，则应从获取文件之日起计算7个工作日作为质疑期限。
• 书面形式的要求：质疑必须以书面形式提出，以确保有明确的记录和证据。书面质疑应包含供应商的名称、联系方式、质疑事项、事实依据和法律依据等内容。
• 特殊情形的处理：在电子招投标等特殊情形下，系统可能自动记录供应商获取文件的时间。此时，应以系统记录及法律法规综合判断质疑的起始时间。同时，不同地区可能会根据当地实际情况制定实施细则，对质疑时间等进行进一步明确和细化。供应商在提出质疑时，应同时参考当地的相关规定。

法律建议：

• 供应商在获取磋商文件后，应尽快审查文件内容，确保对文件中的各项条款和要求有清晰的理解。
• 若发现磋商文件存在问题或疑问，供应商应及时与采购人或采购代理机构沟通，并在规定时间内以书面形式提出质疑。
• 招标人也应密切关注供应商的质疑情况，及时作出答复并妥善处理，以确保招标活动的顺利进行。

如有任何进一步的问题或需要更详细的法律解释，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更全面的法律建议。