在民事诉讼中，若法官将以房抵工程款的纠纷定性为财产权纠纷，判决结果会依据具体案情和法律规定来综合判定，但通常可能包含以下几种情形：

1. 确认以房抵债协议有效，判决房屋归债权人所有：

   • 如果双方签订的以房抵债协议是真实意思表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，且房屋产权清晰，不存在其他权利瑕疵，那么法官可能会确认该协议有效，并判决房屋归债权人（即工程款债权人）所有。
   • 在此情况下，债务人（即工程款债务人）需要协助债权人办理房屋过户手续，将房屋产权转移至债权人名下。

2. 确认以房抵债协议部分有效，对超出部分不予支持：

   • 如果以房抵债协议中约定的房屋价值明显高于工程款数额，且双方未就超出部分达成其他约定，那么法官可能会确认协议中与工程款数额相当的部分有效，对超出部分不予支持。
   • 在此情况下，债权人只能就工程款数额部分获得房屋产权，超出部分可能需要通过其他方式解决，如债务人支付现金等。

3. 确认以房抵债协议无效，判决债务人支付工程款及利息：

   • 如果以房抵债协议存在违反法律、行政法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，导致协议无效，那么法官可能会判决债务人支付工程款及相应的利息。
   • 在此情况下，房屋产权不会转移至债权人名下，债权人需要通过其他法律途径来追讨工程款。

4. 考虑其他因素，如房屋是否存在抵押、查封等权利限制：

   • 如果房屋存在抵押、查封等权利限制，导致无法办理过户手续，那么法官可能会根据具体情况判决债务人承担违约责任，或者解除以房抵债协议并判决债务人支付工程款。
   • 在此情况下，债权人可能需要先解决房屋的权利限制问题，才能进一步主张自己的权益。

在处理此类纠纷时，法官会综合考虑以下因素：

• 双方签订的以房抵债协议是否真实、合法、有效；
• 房屋产权是否清晰，是否存在其他权利瑕疵；
• 工程款数额是否明确，双方是否存在争议；
• 房屋是否存在抵押、查封等权利限制；
• 双方是否存在其他约定或交易习惯等。

建议：在处理以房抵工程款的纠纷时，双方应尽可能签订书面协议，明确约定房屋价值、工程款数额、过户时间等关键条款，以避免后续产生争议。如果发生纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自己的权益和义务，并根据具体情况制定合适的诉讼策略。