结论：工伤期间被扣工资，申请劳动仲裁本身并不直接导致劳动合同的解除。劳动合同的解除需要基于法定的理由和程序，而申请劳动仲裁是劳动者维护自身权益的一种途径，两者并不直接等同。
详细分析：
工伤期间工资支付规定：
- 根据《工伤保险条例》及相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，在工伤期间，用人单位应当按照职工的原工资标准支付工资，不得扣减。
申请劳动仲裁的目的与程序：
- 如果用人单位在工伤期间扣减了职工的工资，职工有权向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求用人单位支付被扣减的工资及可能的赔偿。申请劳动仲裁是劳动者维护自身合法权益的一种法律手段，它本身并不直接导致劳动合同的解除。
劳动合同解除的法定条件：
- 劳动合同的解除需要基于法定的理由和程序。例如，根据《劳动合同法》的规定，用人单位或劳动者可以基于协商一致、劳动者提前通知、用人单位过错等情形解除劳动合同。单纯因为申请了劳动仲裁，并不构成劳动合同解除的法定理由。
可能的法律后果与建议：
- 如果职工在工伤期间被扣工资并申请了劳动仲裁，且仲裁结果支持了职工的诉求，用人单位应当履行仲裁裁决，支付被扣减的工资及可能的赔偿。如果用人单位不履行仲裁裁决，职工还可以向人民法院申请强制执行。
- 在此过程中，如果用人单位存在违法行为（如恶意扣减工资、拒绝履行仲裁裁决等），职工还可以考虑向劳动监察部门投诉或寻求其他法律途径维护自身权益。但无论如何，这些行为都不应被视为职工主动解除劳动合同的理由，除非职工本人有明确的解除意愿并符合法定程序。
特殊情况说明：
- 如果职工在工伤期间因用人单位的违法行为（如长期拖欠工资、恶意扣减工资等）导致无法继续工作，且职工希望解除劳动合同，那么职工可以依据《劳动合同法》的相关规定，以用人单位未及时足额支付劳动报酬等为由提出解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。但这种情况下的解除是基于用人单位的违法行为，而非单纯因为申请了劳动仲裁。
总结与建议：
- 工伤期间被扣工资是违法的，职工有权申请劳动仲裁维护自身权益。但申请劳动仲裁本身并不直接导致劳动合同的解除。
- 如果职工希望解除劳动合同，应当基于法定的理由和程序进行，并考虑是否因此有权获得经济补偿金。
- 在整个过程中，建议职工保留好相关证据（如工资条、工伤认定书、仲裁申请书等），以便在需要时证明自己的权益。
如有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。