员工停职调查期间是否有工资，主要取决于停职的具体原因、用人单位的规章制度以及相关的劳动法律法规。一般情况下，非员工过错导致的停职应支付工资，而员工自身过错导致的停职则可能停发工资。以下是对这一问题的详细分析：
一、非员工过错导致的停职
公司经营调整或内部调查：
- 若停职是由于公司经营调整、业务转型或内部调查等非员工过错原因，公司应按照劳动合同的约定支付工资。若停职时间不超过一个工资支付周期（通常为一个月），应支付全额工资；若超过一个工资支付周期，且员工提供了正常劳动，支付的工资不得低于当地最低工资标准；若员工未提供正常劳动，公司应按照不低于当地最低工资标准的一定比例（各地规定有所不同，一般在70%-80%左右）支付生活费。
员工配合调查：
- 若员工无过错且积极配合企业内部调查，工资应正常发放。这是保障员工基本生活费用和遵循劳动法律法规的要求。
二、员工自身过错导致的停职
严重违反规章制度：
- 若员工严重违反用人单位的规章制度，如多次旷工、违反竞业限制约定等，且用人单位的规章制度符合法律规定、制定程序合法并已向员工公示告知，则在停职期间，用人单位可以不支付工资。但需注意，扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。
涉嫌违法犯罪：
- 当员工因涉嫌违法犯罪被采取限制人身自由措施时，用人单位可以暂时停止劳动合同的履行，不支付工资。但若最终认定员工无罪或不构成应受处罚的情形，恢复履行劳动合同后，用人单位应补发停职期间的工资。
员工主动申请停职：
- 在这种情况下，工资将会全部被停发，因为员工是自愿放弃工作机会和相应的劳动报酬。
三、特殊情形
- 部分公司规定，即使员工因行为不当被停职，但在未被解除劳动合同前仍可能支付部分工资，如基本工资或按天计算的工资，作为对员工的基本生活保障和对其他员工的警示。但这一规定需符合法律法规的强制性要求，且不得损害员工的合法权益。
四、法律依据
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及《工资支付暂行规定》等相关法律法规，停职期间劳动关系仍然存在，公司需支付员工一定工资以保障其基本生活需求。同时，公司对停职员工的管理应设置明确期限，并明确复职条件、时间等。
五、建议与行动
公司层面：
- 明确停职原因，并依据公司规章制度或劳动合同约定确定工资发放标准。
- 加强与员工沟通协商，确保停职期间工资发放问题得到妥善处理。
- 遵守法律法规，确保停职管理的合法性、合理性。
员工层面：
- 了解停职决定及工资发放标准的依据。
- 如对停职决定或工资发放有异议，可向当地劳动仲裁委员会提出申诉，并提交相关证据维护自己的合法权益。
在处理停职期间工资问题时，用人单位和员工都应充分了解相关法律法规和合同约定，以确保双方权益得到妥善保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。