公司查到下属与上司之间转账是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 转账性质合法且合规：

   • 如果下属与上司之间的转账是基于合法的业务往来，如报销、借款、还款、工资支付或奖金发放等，并且这些转账行为符合公司的财务制度和相关法律法规的规定，那么这种转账行为是合法的，公司查到后也不会认为其违法。
   • 例子：下属因公出差产生费用，向上司申请报销，上司通过公司账户或个人账户（在符合公司规定的情况下）向下属支付报销款项，这种转账行为就是合法的。

2. 转账性质违法或存在违规情形：

   • 贪污受贿：如果下属与上司之间的转账涉及贪污、受贿等违法行为，如上司利用职务之便向下属索取财物，或者下属为了谋取不正当利益向上司行贿，那么这种转账行为就是违法的。
   • 挪用资金：如果上司或下属利用职务之便，将公司资金挪用于个人用途，并通过转账的方式进行操作，这种行为也构成违法，可能涉及挪用资金罪等刑事责任。
   • 违反财务制度：即使转账行为本身不涉及违法犯罪，但如果违反了公司的财务制度或相关法律法规的规定，如未经批准擅自进行大额转账、使用虚假发票进行报销等，这种行为也可能受到公司的纪律处分或相关法律法规的制裁。
   • 例子：上司为了个人利益，指示下属将公司资金转入其个人账户，用于购买房产或投资等，这种行为就可能构成挪用资金罪。

3. 转账行为存在争议或模糊地带：

   • 在某些情况下，下属与上司之间的转账行为可能既不完全合法也不完全违法，或者存在争议和模糊地带。例如，一些看似合理的转账行为可能实际上隐藏着利益输送或权力寻租的意图。
   • 建议：对于这类转账行为，公司应进行深入调查，了解转账的具体背景、目的和金额等信息，并根据公司的财务制度和相关法律法规的规定进行判断和处理。

法律建议：

• 对于公司而言，应建立健全的财务制度和内部控制机制，加强对员工转账行为的监督和管理，防止违法违规行为的发生。
• 对于员工而言，应遵守公司的财务制度和相关法律法规的规定，不得利用职务之便进行违法违规的转账行为。如果遇到转账方面的疑问或问题，应及时向公司财务部门或法律顾问咨询。

可能后果：

• 如果下属与上司之间的转账行为被认定为违法或违规，他们可能面临公司的纪律处分、民事赔偿甚至刑事责任等后果。具体后果取决于转账行为的性质、金额和情节等因素。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。