结论：县政府将农村合作社流转土地征收后卖给水投公司的行为是否合法，需结合土地性质、征收程序、补偿安置及用途是否符合公共利益等多方面综合判断，以下分情况说明：

1. 土地性质与征收权限

• 集体经营性建设用地：若流转土地为集体经营性建设用地（如原为乡镇企业用地或通过规划调整转为经营性用途），根据《土地管理法》第63条，需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或三分之二以上村民代表同意，并报县级政府批准后，方可入市流转或征收。若县政府未履行法定程序直接征收，可能涉嫌违法。
• 农用地（耕地、林地等）：若土地为农用地，根据《土地管理法》第44条，征收需先办理农用地转用审批手续（由国务院或省级政府批准），并符合土地利用总体规划。若未获批转用即征收，程序违法。

2. 征收程序合法性

• 公共利益前提：根据《土地管理法》第45条，征收土地需以公共利益为目的（如基础设施、公益事业等）。若水投公司购地用于商业开发（如房地产、工业项目），则不符合公共利益，征收行为违法；若用于水利设施、供水工程等公共项目，则可能合法。
• 法定程序履行：征收需履行“公告—听证—补偿安置—报批”等程序（如《土地管理法》第47-48条）。若县政府未公告征收范围、补偿标准，或未与合作社签订补偿协议即强制征收，程序违法。

3. 补偿安置合理性

• 根据《土地管理法》第48条，征收土地应给予公平、合理的补偿，包括土地补偿费、安置补助费、地上附着物补偿等，并保障被征地农民原有生活水平不降低。若补偿明显低于市场价或未落实安置措施，合作社可主张征收违法。

4. 流转合同效力影响

• 若合作社与农户的流转合同中明确约定“土地被征收时补偿归农户所有”，则县政府应直接向农户支付补偿；若合同未约定或约定模糊，可能引发合作社与农户之间的纠纷，但不影响征收本身的合法性判断。

建议行动

1. 核查征收文件：要求县政府出示征收批文、规划许可、补偿方案等文件，确认是否符合法定程序。
2. 申请信息公开：向自然资源部门申请公开土地用途、规划调整等信息，核实是否以公共利益为目的。
3. 协商或诉讼：若发现程序违法或补偿不合理，可先与县政府协商；协商不成，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

如有进一步证据或细节（如土地性质、征收公告内容等），可直接向我咨询，我将结合具体情形提供法律意见。