结论：处理违法建筑时，不应擅自采取停水停电措施，而应依法进行查处和拆除。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与程序
核心法律未明确授权：
- 《中华人民共和国城乡规划法》等核心法律并未明确授权相关行政执法部门可以采取断水断电的方式迫使当事人拆除违法建筑。这意味着，从法律层面讲，停水停电并非处理违法建筑的常规或法定手段。
法定程序要求：
- 任何针对违法建筑的处理措施都必须严格遵循法定程序。这包括明确的法律依据、充分的调查取证、认定该建筑确实属于违法建筑，以及在实施任何措施前书面告知当事人相关的事实、理由和依据，并给予当事人陈述和申辩的机会。停水停电若未经法定程序，则可能构成违法。
二、停水停电的合法性与合理性分析
合法性存疑：
- 未经法定程序和行政机关要求，供水供电企业擅自对违法建筑停水停电，属于企业的不当行为，侵害了用户基于供水供电合同所享有的合法权益。即使行政机关有权采取此类措施，也必须确保程序的合法性和正当性，不能随意扩大解释或滥用权力。
合理性不足：
- 断水断电等行为会严重影响当事人的基本生活，可能引发社会不稳定因素。对于违法建筑的处理，应更注重通过法律手段进行纠正和引导，而非采取极端措施。此外，停水停电还可能构成滥用职权，损害政府公信力。
三、正确处理方式
依法查处与拆除：
- 相关部门应依法对违法建筑进行查处，并按照法定程序进行拆除。这包括调查取证、认定违法事实、作出处罚决定以及执行拆除等步骤。通过法律手段进行纠正，既能维护法律尊严，又能保障当事人的合法权益。
加强法律法规宣传与教育：
- 通过加强法律法规的宣传和教育，提高公众的法制意识和规划意识，从源头上减少违法建筑的产生。这有助于构建一个更加和谐、有序的城市环境，减少因违法建筑而引发的社会矛盾和冲突。
四、特殊情况下的处理
若行政机关依法决定采取停水停电措施：
- 即使在这种情况下，也必须确保程序的合法性和正当性。行政机关应书面告知当事人相关的事实、理由和依据，并给予当事人陈述和申辩的机会。同时，应尽可能减少对当事人基本生活的影响，避免引发社会不稳定因素。
若供水供电企业被要求配合执行停水停电：
- 供水供电企业应严格审查行政机关的决定是否合法有效，并确保在执行过程中不损害用户的合法权益。若行政机关的决定存在违法或不当之处，供水供电企业有权拒绝执行，并向相关部门报告。
建议：在处理违法建筑时，应坚持依法依规、程序正义的原则，避免采取不当手段如停水停电等。同时，通过加强法律法规的宣传和教育，引导公众自觉遵守法律法规，共同维护城市规划和建设秩序。若您遇到相关法律问题，可直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。