针对市场监督管理局扣押的不合格电动自行车的处理方式，这通常取决于具体的违法事实、相关法律法规以及市场监管部门的裁量。以下是一般性的处理流程和相关法律依据的详细解释：
一、处理流程
扣押与鉴定：
- 市场监督管理局在执法过程中，如发现电动自行车存在质量问题或不符合相关标准，会依法进行扣押。
- 扣押后，市场监管部门会委托有资质的检测机构对电动自行车进行质量鉴定，以确认其是否合格。
行政处罚决定：
- 根据鉴定结果，如果电动自行车被确认为不合格产品，市场监管部门会依据相关法律法规作出行政处罚决定。
- 处罚决定可能包括没收不合格电动自行车、罚款等措施。例如，在河北省廊坊市大城县的案例中，市场监管部门没收了不合格电动自行车2辆，并罚款4080元；在兴城市的案例中，也有没收不合格电动自行车并罚款的处罚。
执行与上缴：
- 行政处罚决定作出后，市场监管部门会依法执行，包括没收不合格电动自行车和收缴罚款。
- 没收的电动自行车通常会被销毁或进行其他无害化处理，以防止其再次流入市场。
- 罚款则会上缴国库。
后续监管：
- 市场监管部门还会对涉案商家进行后续监管，确保其整改到位，并防止类似违法行为再次发生。
二、法律依据
《中华人民共和国产品质量法》：
- 该法规定了产品质量的基本要求、生产者和销售者的产品质量责任和义务，以及市场监管部门的监管职责和处罚措施。
- 在电动自行车不合格的情况下，市场监管部门可以依据该法第四十九条等规定进行处罚。
《中华人民共和国认证认可条例》：
- 如果电动自行车未经认证认可或不符合认证认可一致性规定，市场监管部门可以依据该条例进行处罚。
- 例如，在兴城市的案例中，商家因销售未经认证认可的电动自行车而受到处罚。
三、建议与提醒
- 商家应严格遵守法律法规：商家在销售电动自行车时，应确保产品符合相关标准和认证要求，避免销售不合格产品。
- 消费者应提高警惕：消费者在购买电动自行车时，应选择正规渠道和知名品牌，注意查看产品合格证和认证标志，确保购买到合格产品。
- 市场监管部门应加强监管：市场监管部门应继续加强对电动自行车市场的监管力度，严厉打击非法生产、销售不合格电动自行车的行为，保障消费者权益和市场秩序。
综上所述，市场监督管理局扣押的不合格电动自行车会根据具体违法事实和相关法律法规进行相应处理，包括没收、罚款等措施，并会加强后续监管以防止类似违法行为再次发生。