针对您提出的“销售已上牌的不合格电动自行车如何处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规及实际案例为您提供的详细解答：
一、处罚依据
销售已上牌的不合格电动自行车，主要违反了《中华人民共和国产品质量法》以及《强制性产品认证管理规定》等相关法律法规。这些法规明确规定了电动自行车必须符合国家强制性标准，且必须通过认证认可程序，确保产品的安全性和合规性。
二、处罚措施
没收违法所得：
- 如果销售者通过销售不合格电动自行车获得了违法所得，市场监管部门将依法没收这部分所得。例如，在兴城市xx电动车商店的案例中，该店因销售未经认证认可的电动自行车，被没收违法所得900元。
罚款：
- 销售不合格电动自行车，市场监管部门将根据违法情节的轻重，对销售者处以罚款。罚款金额通常根据货值金额的一定比例来确定，也可能直接规定一个具体的罚款数额。如兴城市xx电动车销售服务商行因销售不符合保障人身、财产安全的国家标准产品，被按货值金额1.3倍罚款1950元。
没收不合格产品：
- 对于已经销售但尚未售出的不合格电动自行车，市场监管部门将依法予以没收，以防止其继续流入市场，危害消费者安全。如观山湖区夏吴电动车经营部因销售不符合强制性产品认证管理规定的电动自行车，被没收相关不合格产品（虽案例中提及已整改，但若未整改或整改不合格，则会被没收）。
其他行政处罚：
- 根据违法情节的严重程度，市场监管部门还可能采取其他行政处罚措施，如责令停业整顿、吊销营业执照等。
三、处罚裁量因素
在具体处罚时，市场监管部门会综合考虑以下因素来裁量处罚的轻重：
违法情节的轻重：
- 包括销售不合格电动自行车的数量、货值金额、违法所得等。
销售者的主观过错：
- 如是否明知产品不合格而故意销售，或者是否因疏忽大意而销售了不合格产品。
社会危害程度：
- 如不合格电动自行车是否已经造成或可能造成消费者人身伤害或财产损失。
销售者的配合态度：
- 如是否积极配合市场监管部门的调查取证工作，是否主动采取措施消除或减轻违法行为危害后果等。
四、典型案例参考
兴城市xx电动车商店案例：
- 销售未经认证认可的电动自行车，被没收违法所得900元，罚款3000元。
兴城市xx电动车销售服务商行案例：
- 销售不符合保障人身、财产安全的国家标准产品，被没收不合格的电动自行车1辆，按货值金额1.3倍罚款1950元。
观山湖区夏吴电动车经营部案例：
- 销售不符合强制性产品认证管理规定的电动自行车，虽已自行整改，但若未整改或整改不合格，将面临没收不合格产品及相应罚款的处罚。
五、建议与提醒
严格遵守法律法规：
- 销售者应严格遵守国家关于电动自行车的强制性标准和认证认可规定，确保所销售的产品符合安全要求。
加强产品质量控制：
- 建立完善的产品质量控制体系，对进货渠道进行严格把关，确保所销售的产品质量可靠。
积极配合监管工作：
- 如遇到市场监管部门的检查或调查，应积极配合并提供相关证据材料，以减轻或避免处罚。
综上所述，销售已上牌的不合格电动自行车将面临严厉的处罚措施。为了您的合法权益和消费者的安全，请务必严格遵守相关法律法规，确保所销售的产品符合国家标准和认证要求。