公司认为盖公章行为不是表见代理，并不能直接推定公章就是公司的。以下是对这一问题的详细分析：

一、表见代理与公章的关系

表见代理是指行为人虽无代理权，但因被代理人的行为造成了足以使善意相对人相信其有代理权的表象，而与善意相对人进行的、由本人承担法律后果的代理行为。在表见代理中，公章的使用往往是一个重要的判断因素，但并非唯一因素。公章作为公司的重要标识，其使用确实能在一定程度上代表公司的意志，但公章的使用是否构成表见代理，还需结合其他因素综合判断，如行为人的身份、行为方式、交易习惯等。

二、公司否认表见代理的法律后果

如果公司认为盖公章行为不是表见代理，这通常意味着公司不承认该行为所产生的法律后果由公司承担。然而，这并不意味着公章就不是公司的。公章的真实性、合法性以及使用权限是另一个层面的问题。即使公司否认表见代理，也不能直接否定公章的归属或有效性。

三、公章归属的判断标准

1. 公章的合法性：首先，需要确认公章是否经过合法登记或备案，是否符合相关法律法规的规定。
2. 公章的使用权限：其次，要考察公章的使用是否在公司授权范围内。如果公章被非法使用或超出授权范围使用，那么该使用行为可能无效，但这并不影响公章本身的归属。
3. 公章的实际控制：此外，公章的实际控制情况也是判断其归属的重要因素。如果公章被某人非法占有或使用，而公司并未失去对公章的实际控制权（如通过挂失、公告等方式），那么公章仍然属于公司。

四、可能涉及的法律纠纷及建议

1. 民事纠纷：如果因公章使用问题引发民事纠纷，如合同纠纷、侵权纠纷等，公司应积极收集证据，证明公章的使用并非公司意志或超出公司授权范围，以维护自身合法权益。
2. 刑事纠纷：如果公章被非法盗用或伪造，并用于犯罪活动，公司应及时向公安机关报案，并配合调查取证工作。同时，公司也可以考虑通过民事诉讼途径追究相关责任人的法律责任。

建议：

• 加强公章管理：公司应建立健全公章管理制度，明确公章的使用权限和审批流程，防止公章被非法使用或滥用。
• 及时采取措施：一旦发现公章被非法使用或盗用，公司应立即采取措施，如挂失、公告等，以减少损失并维护自身权益。
• 寻求法律帮助：如果因公章使用问题引发法律纠纷，公司应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，并制定合适的应对策略。

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