结论：公司打款给商场营业员，再由商场营业员让商场开发票给公司的行为，其合法性需根据具体情况来判断，但通常这种操作方式存在较大的法律风险，不建议采用。
详细分析：
从发票管理法规的角度：
- 根据我国发票管理法规，发票的开具应当基于真实的交易关系。即，商场应当基于其与公司之间的实际交易（如销售商品或提供服务）来开具发票。
- 如果公司打款给商场营业员，而商场并未与公司发生实际的交易关系，那么商场开具发票给公司就缺乏真实的交易背景，这可能构成虚开发票的行为，是违法的。
从税务合规的角度：
- 公司打款给营业员，再由营业员让商场开发票，这种操作方式可能涉及资金流与发票流的不一致，容易引发税务部门的关注和调查。
- 税务部门在核查时，会关注资金流、发票流和货物流（或服务流）是否一致。如果这三者之间存在不一致，就可能被视为税务违规行为，面临税务处罚。
从公司财务和税务风险的角度：
- 这种操作方式可能给公司带来不必要的财务和税务风险。一旦被发现存在虚开发票或资金流与发票流不一致的情况，公司可能面临税务罚款、滞纳金等处罚，甚至可能影响公司的信誉和正常运营。
法律建议：
- 避免违规操作：公司应当避免采用这种可能涉及虚开发票或资金流与发票流不一致的操作方式。如果确实需要与商场进行交易，应当确保交易的真实性和合法性，并按照规定开具和取得发票。
- 加强内部管理：公司应当加强内部管理，确保财务和税务操作的合规性。可以建立完善的财务和税务制度，明确发票的开具、取得和保管等流程，降低税务风险。
- 咨询专业律师：如果公司对税务合规方面存在疑问或不确定，建议咨询专业律师或税务师，以获取更具体和专业的法律建议。
可能后果：
- 如果公司被税务部门发现存在虚开发票或资金流与发票流不一致的情况，可能面临税务罚款、滞纳金等处罚。
- 公司的信誉和正常运营也可能受到影响，甚至可能引发更严重的法律后果。
综上所述，公司打款给商场营业员，再由商场营业员让商场开发票给公司的行为存在较大的法律风险，不建议采用。公司应当加强内部管理，确保财务和税务操作的合规性，并在必要时咨询专业律师或税务师。