结论：公司无权擅自拿走工伤病历原件，但可在劳动者同意下复印用于正当事务。以下是对这一问题的详细分析：
一、病历的所有权与知情权
患者权益：工伤病历是记录劳动者诊疗过程的重要医疗资料，根据法律规定，患者（即劳动者）对其享有所有权和知情权。这意味着劳动者有权自行妥善保管病历原件，以保障自身合法权益不受侵害。
公司权利限制：尽管公司在处理工伤认定、申请工伤保险待遇等事务时需要病历资料，但这并不意味着公司有权未经劳动者允许直接拿走病历原件。公司应尊重劳动者的所有权，仅在劳动者同意后，方可复印病历资料用于相应事务。
二、病历在实际操作中的应用
工伤认定与理赔流程：为了及时、顺利地完成工伤认定和理赔流程，劳动者可以配合公司复印相关病历资料，以便公司提交给社保部门等相关机构。但原件应始终掌握在劳动者自己手中，以确保其合法权益得到有效保障。
停工留薪期确定：单位可能需要根据出院证明的入出院时间和医师建议继续休养时间来确定停工留薪期。在此情况下，劳动者同样可以提供复印件或配合单位进行复印，但原件仍应由劳动者保管。
三、争议解决与法律保障
双方分歧处理：如双方就病历原件归属产生分歧，应依据相关法律法规及双方签订的合同约定进行处理。在处理过程中，应首先确保劳动者的合法权益得到保障。
法律途径解决：若公司擅自拿走病历原件或存在其他不当行为，劳动者可通过法律途径维护自己的权益。例如，向劳动监察部门投诉或寻求法律援助等。在此过程中，劳动者可以保留相关证据，如病历复印件、公司拿走病历的证明等，以便在需要时提供给相关部门或法院。
病历复印与证明：如劳动者需要做工伤级别鉴定而病历原件被公司拿走，可自行到工伤入住院治疗的医院的医政管理部门查阅并复印住院病历，并要求医院加盖印章以作证明。这样，劳动者就可以在不影响工伤认定和理赔流程的前提下，保障自己的合法权益。
建议：作为劳动者，在面对工伤病历归属问题时，应明确自己的权益和公司的权利限制。在配合公司复印病历资料的同时，务必保管好病历原件。如遇公司擅自拿走病历原件或其他不当行为，应及时通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。