关于单位办理停薪留职后是否有补偿的问题，这主要取决于停薪留职期间的具体情况以及劳动合同或停薪留职协议中的相关约定。以下是对此问题的详细解答：

一、停薪留职期间的基本待遇

在停薪留职期间，职工与用人单位的人事或劳动合同关系依然保留，工龄会连续计算，不受中断影响。同时，根据相关法律法规和劳动合同的具体条款，用人单位通常会继续为停薪留职职工缴纳社保（包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险）以及住房公积金。但需要注意的是，社保和公积金中原本由单位和个人分别承担的部分，可能需要职工个人以某种方式支付给单位，再由单位统一缴纳，具体承担方式应依据双方签订的停薪留职协议来确定。

二、停薪留职期间是否有补偿

1. 正常停薪留职期间：

   • 在正常的停薪留职期间，由于职工并未实际为公司提供劳动服务，因此通常不会获得工资、奖金、津贴等福利待遇。但这并不意味着职工没有权益保障，其工龄会连续计算，且社保通常继续缴纳。
   • 在此期间，如果没有发生劳动合同解除或终止的情况，那么职工不会获得额外的经济补偿。

2. 停薪留职期间被辞退：

   • 如果停薪留职员工在停薪留职期间被辞退，是否有补偿则需根据具体情况分析。
   • 若员工严重违反用人单位的规章制度，如多次旷工、营私舞弊给单位造成重大损害等，且这些行为符合《劳动合同法》第三十九条规定的情形，用人单位有权解除劳动合同且无需支付经济补偿。
   • 若用人单位与停薪留职员工双方协商一致解除劳动合同，或者用人单位没有法定理由随意辞退员工（即违法解除劳动合同），则根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位应向劳动者支付经济补偿或赔偿金。经济补偿的计算方式通常按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；赔偿金则是经济补偿标准的二倍。

三、签订停薪留职协议的重要性

由于不同地区、不同单位对于停薪留职的具体规定和待遇安排可能存在差异，因此在办理停薪留职手续时，职工务必与用人单位签订详细的停薪留职协议。该协议应明确双方的权利和义务，尤其是关于各项待遇的具体约定（如社保缴纳方式、经济补偿等），以避免后续可能出现的纠纷。

四、建议

在决定停薪留职之前，建议您仔细阅读劳动合同内容，并与公司的相关部门或专业人士进行充分沟通，以确保自己的权益得到充分保障。同时，在签订停薪留职协议时，务必仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到明确约定和保障。