当公司法定代表人起诉公司时，公司应由除法定代表人外的其他负责人或指定代表来应诉。以下是对这一问题的详细分析：
一、法定代表人起诉公司的特殊性
通常情况下，法定代表人是代表公司行使职权的负责人，其以公司名义从事的民事活动所产生的权利义务由公司承担。然而，当法定代表人与公司之间发生纠纷，并且该纠纷是基于其个人名义进行的民事行为时，法定代表人与公司之间的地位变为平等，此时法定代表人有权以个人名义起诉公司。这种情况下，由于法定代表人同时是原告，因此不能由其代表公司应诉，以避免角色冲突和不公正现象的发生。
二、公司应诉主体的选择
其他负责人：
- 公司应由除法定代表人外的其他负责人，如董事长（若非法定代表人）、副董事长、总经理等高级管理人员代表公司参与诉讼。这些人员通常对公司业务有深入了解，能够代表公司进行有效的应诉。
指定代表：
- 若公司无其他合适的负责人，可通过股东会、董事会等决策程序临时指定一名代表，并出具授权委托书，以公司名义参加诉讼。这种方式能够确保公司在诉讼过程中有明确的代表，维护公司的合法权益。
委托律师代理：
- 公司也可以依法委托律师或其他代理人参加诉讼。律师具有专业的法律知识和丰富的诉讼经验，能够为公司提供全面的法律服务，包括分析法律关系、制定诉讼策略、进行辩论等。在复杂的知识产权纠纷、重大经济合同纠纷等案件中，律师的作用尤为重要。
三、应诉材料的准备与程序要求
- 应诉材料：公司在确定应诉人员后，需向法院提交相关的身份证明文件和授权委托书等材料。这些材料用于证明应诉人员的身份和权限，确保诉讼活动的合法性和有效性。
- 程序要求：公司应严格遵守相关法律法规和诉讼程序要求，如提出答辩状、参与庭审过程、依法行使诉讼权利、履行诉讼义务等。通过合理的应诉策略和专业的法律服务，公司可以有效地维护自身的合法权益。
四、实际案例与法律建议
- 实际案例：在实际操作中，曾有公司法定代表人因与公司发生合同纠纷而起诉公司的情况。公司通过指定其他负责人或委托律师代理应诉，最终成功维护了公司的合法权益。
- 法律建议：当公司面临法定代表人起诉的情况时，应首先分析纠纷的性质和法律依据，确定应诉策略。同时，公司应积极配合应诉人员的工作，提供必要的支持和协助，确保应诉工作的顺利进行。
总结：当公司法定代表人起诉公司时，公司应由除法定代表人外的其他负责人或指定代表来应诉。公司可以根据实际情况选择合适的应诉主体，并严格遵守相关法律法规和诉讼程序要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。