结论：在民事案件中起诉担保人后，仍然可以就同一案件中的相关事实对当事人提起刑事诉讼，但需注意两种诉讼的性质、目的及证据要求存在差异，且需确保不违反“一事不再理”原则（针对同一事实和法律关系，刑事与民事诉讼通常不构成该原则的冲突）。以下从不同角度详细分析：
一、民事诉讼与刑事诉讼的性质与目的差异
民事诉讼：主要解决平等主体之间的财产关系和人身关系纠纷，如债务纠纷、合同纠纷等。其目的在于通过司法程序确认民事权利义务关系，并保障民事权益的实现。在债务债权案件中，起诉担保人通常是为了追偿债务，要求担保人承担担保责任。
刑事诉讼：则主要解决犯罪嫌疑人、被告人的刑事责任问题。其目的在于惩罚犯罪，保护社会秩序和公共利益。如果当事人（如债务人）的行为构成犯罪（如诈骗、合同诈骗等），则可能面临刑事诉讼的追究。
二、民事诉讼与刑事诉讼的证据要求
民事诉讼：证据要求相对较低，只需达到“高度盖然性”标准，即一方提供的证据能够使法官相信其主张的事实存在具有高度可能性。
刑事诉讼：证据要求则更为严格，必须达到“排除合理怀疑”标准，即证据必须充分、确凿，能够排除一切合理怀疑，证明犯罪嫌疑人、被告人有罪。
三、民事诉讼与刑事诉讼的独立性
独立性原则：民事诉讼与刑事诉讼是两种独立的司法程序，它们之间互不影响。因此，在民事案件中起诉担保人后，并不妨碍就同一案件中的相关事实对当事人提起刑事诉讼。
例外情况：虽然民事诉讼与刑事诉讼独立，但需注意避免对同一事实进行重复评价。例如，如果民事诉讼中已经对当事人的行为进行了法律评价（如认定为违约行为），且该评价与刑事诉讼中的犯罪构成要件无直接关联，则不影响刑事诉讼的提起。然而，如果民事诉讼中的事实认定直接涉及刑事犯罪构成要件（如诈骗行为），则需谨慎处理，以避免对同一事实进行双重评价。
四、实际操作中的注意事项
证据收集与保存：在提起刑事诉讼前，应确保有充分的证据证明当事人的犯罪行为。这包括收集、固定和保存相关证据，如合同、转账记录、聊天记录等。
法律程序遵循：提起刑事诉讼需遵循严格的法律程序，包括向公安机关报案、配合调查、提供证据等。同时，也需注意保护自身合法权益，避免在刑事诉讼过程中受到不必要的损害。
专业律师协助：由于刑事诉讼涉及复杂的法律问题和严格的证据要求，建议寻求专业律师的协助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助当事人更好地维护自身权益。
五、可能面临的法律后果
刑事责任：如果当事人的行为构成犯罪，将面临刑事责任的追究，包括有期徒刑、罚金等刑罚。
民事责任：无论当事人是否承担刑事责任，都不影响其承担民事责任。即如果担保人承担了担保责任后，仍有权向当事人追偿；同时，如果当事人的行为给债权人造成了损失，债权人也有权要求当事人承担赔偿责任。
建议：在处理此类案件时，应综合考虑民事诉讼与刑事诉讼的性质、目的及证据要求等因素，谨慎决定是否提起刑事诉讼。如有需要，请直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议。