关于基础工资（这里假设您所指的基础工资包含基础性绩效工资等固定组成部分）能否被扣款的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要依据具体情况来综合判断。以下是我为您详细梳理的分析：
一、合法扣除基础工资的情形
合同中有明确约定：
- 如果您的劳动合同或相关补充协议中明确规定了基础工资的扣减情形，比如因违反公司规章制度、未达成既定工作指标等，并且这些规定并不违反国家法律法规的强制性规定，那么在这种情况下，按照合同执行扣减是合法的。
公司规章制度有规定：
- 公司内部的规章制度如果明确规定了基础工资的扣减规则，并且这些规则已经经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）、向员工进行了公示，且您知晓并同意遵守这些规定，那么在符合规章制度规定的情况下，扣减基础工资也是合理的。
因您个人原因造成公司损失：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，如果您因个人原因给用人单位造成了经济损失，用人单位有权要求您赔偿经济损失，并从您的工资中扣除。但这里需要注意的是，扣除的部分有法定限额，即每月扣除的部分不得超过您当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
二、违法扣除基础工资的情形
无制度或合同依据：
- 如果用人单位没有相关的规章制度或劳动合同约定，或者规章制度未经合法程序制定和公示，却随意扣除您的基础工资，这种行为是违法的。
制度或合同约定违法：
- 即使有用人单位的规章制度或劳动合同约定，但如果这些规定违反了国家法律法规的强制性规定（如公平原则、工资支付规定等），那么这些规定也是无效的。例如，无条件扣除一定比例的基础工资的规定就属于此类。
滥用扣除权：
- 如果用人单位扣除您基础工资的目的不是基于合理的管理需要，而是为了变相降低您的工资、惩罚您等不正当目的，那么这属于滥用扣除权，同样是违法的。
三、操作建议
沟通与确认：
- 在用人单位提出扣减基础工资之前，建议您与用人单位进行充分沟通，明确了解扣减的原因、依据以及具体金额，确保自己的权益不受侵害。
保留证据：
- 如果您认为用人单位的扣减行为可能存在问题，建议您保留好相关证据，如劳动合同、规章制度、工资条等，以备不时之需。
争议解决：
- 如果您与用人单位在扣减基础工资问题上存在争议，首先可以尝试与用人单位协商解决。如果协商不成，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
综上所述，基础工资能否被扣款取决于具体的合同约定、公司规章制度、法律法规以及扣减原因。在任何情况下，用人单位都应确保扣减行为的合法性、合理性和公正性。如果您对此有任何疑问或担忧，建议您及时咨询专业律师或相关劳动部门以获取更具体的指导。