公司不按工龄，而按自然年核算年假，这一做法是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度或劳动合同中有明确规定按自然年核算年假，且该规定不违反法律法规的强制性规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平，这同样适用于年假的核算方式。只要公司的规定不违反法律法规的强制性规定，且经过民主程序制定并公示或告知劳动者，那么该规定就是有效的。
   • 在此情况下，公司按自然年核算年假是合法的，劳动者应当遵守。

2. 若公司规章制度或劳动合同中未明确规定年假核算方式，或规定与法律法规相冲突：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第三条，职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。这里的“累计工作”年限，通常理解为包括职工在同一或者不同用人单位工作期间，以及依照法律、行政法规或者国务院规定视同工作期间。
   • 如果公司无视职工的工龄，一律按自然年核算年假，且未给予职工相应的工龄年假待遇，那么这种做法可能违反了《职工带薪年休假条例》的规定，是不合法的。
   • 在此情况下，劳动者有权要求公司按照其工龄核算年假，并享受相应的年假待遇。

建议与行动：

• 劳动者应首先查阅公司的规章制度和劳动合同，了解年假的具体核算方式。
• 如果认为公司的做法不合法，可以与公司进行协商，要求公司按照工龄核算年假。
• 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

额外提醒：

• 劳动者在维护自己权益的同时，也应注意保留相关证据，如工作证明、工资单、公司规章制度等，以便在需要时提供证明。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。