结论：作为下游经营者，在上游因无证经营烟草被公安立案的情况下，你确实存在被查处的风险，但具体是否会被查以及查处的程度，取决于多种因素。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律背景与风险分析
无证经营烟草的法律后果：
- 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及相关实施条例，未经许可经营烟草制品零售业务的，由烟草专卖行政主管部门或者由工商行政管理部门根据烟草专卖行政主管部门的意见，责令停止经营烟草制品零售业务，没收违法所得，并处罚款。
- 若上游无证经营烟草的行为被公安立案，说明其行为可能已涉嫌非法经营罪或其他相关犯罪，这通常意味着上游的经营行为具有较大的违法性和社会危害性。
下游经营者的风险：
- 作为下游经营者，如果你明知上游无证经营烟草而仍然从其处进货并销售，那么你的行为也可能构成违法，甚至可能涉嫌共同犯罪（如果上游的行为构成犯罪的话）。
- 即使你不知情，但如果能够证明你在进货时未尽到合理的审查义务（如未查验上游的烟草专卖零售许可证等），你也可能面临行政处罚。
二、可能面临的查处情况
行政调查与处罚：
- 烟草专卖行政主管部门或工商行政管理部门可能会对你进行调查，了解你与上游的交易情况、进货渠道等。
- 如果调查发现你存在违法行为，如无证经营或从无证经营者处进货，你可能会面临没收违法所得、罚款等行政处罚。
刑事调查与追责：
- 如果上游的行为构成犯罪，且你被认定为共同犯罪或存在其他严重违法行为，公安部门可能会对你进行刑事调查。
- 在刑事调查过程中，你可能会面临被拘留、逮捕等强制措施，以及后续的刑事审判和刑罚。
三、法律建议与应对措施
立即停止与上游的交易：
- 如果你目前仍在与上游进行交易，应立即停止，以避免进一步的法律风险。
主动配合调查：
- 如果相关部门已经对你展开调查，应主动配合，如实提供相关信息和证据。
- 不要试图隐瞒或伪造证据，这可能会加重你的法律责任。
寻求法律帮助：
- 如果你对法律程序或自己的权利义务不清楚，可以寻求专业律师的帮助。
- 律师可以为你提供法律咨询、代理诉讼等法律服务，帮助你更好地应对调查和处罚。
加强内部管理：
- 在未来的经营活动中，应加强内部管理，确保进货渠道合法合规。
- 定期对供应商进行审查，确保其具备相应的经营资质和许可证。
最后，作为下游经营者，在上游因无证经营烟草被公安立案的情况下，你确实存在被查处的风险。但具体是否会被查以及查处的程度，取决于你的行为是否违法、违法情节的严重程度以及相关部门的调查情况。因此，建议你立即停止与上游的交易，主动配合调查，并寻求法律帮助以应对可能的法律风险。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。