结论前置：九五年批准宅基地超面积向村委交纳费用是否合法，主要取决于当时的法律法规、政策规定以及具体的收费程序。若收费有明确的法律法规或政策依据，且程序合法，则是合法的；反之，则可能不合法。

详细分析：

1. 合法收费情形：

   • 依据法律法规或政策：在九五年，如果地方政府或相关部门已经出台了关于宅基地超面积收费的相关法律法规或政策，并且这些规定是合法有效的，那么村民在宅基地超出规定面积时，按照这些规定向村委交纳费用是合法的。
   • 程序合法：除了有法律法规或政策依据外，收费过程还需要遵循法定程序，如提前公示收费标准、收费依据和方式，确保收费的透明性和公正性。如果程序合法，那么收费行为也是合法的。

2. 不合法收费情形：

   • 无法律法规或政策依据：如果九五年时，地方政府或相关部门并未出台关于宅基地超面积收费的相关法律法规或政策，或者出台的规定与上位法相抵触，那么村委向村民收取超面积费用就是不合法的。
   • 程序不合法：即使存在相关法律法规或政策依据，但如果收费过程中未遵循法定程序，如未提前公示或存在乱收费、强制收费等行为，那么该收费行为也是不合法的。

3. 历史遗留问题：

   • 考虑到九五年距离现在已有较长时间，当时的法律法规和政策可能与现在有所不同。因此，在处理这类历史遗留问题时，需要综合考虑当时的法律环境、政策背景以及具体情况。
   • 如果当时的收费行为是基于当时的法律法规或政策进行的，并且程序合法，那么即使现在看来可能存在不合理之处，也不能简单地认定为不合法。

建议：

• 对于九五年批准宅基地超面积向村委交纳费用的问题，建议首先查询当时的法律法规和政策规定，以确定收费是否有明确的依据。
• 如果无法查询到当时的法律法规和政策规定，或者规定不明确，建议咨询当地的土地管理部门或专业律师，以获取更准确的信息和建议。
• 如果认为收费行为存在不合法之处，可以通过法律途径维护自身权益，如向相关部门反映情况或提起诉讼。