关于农村基层组织（如村委会）收取宅基费是否合法的问题，这确实是一个涉及法律法规、地方政策以及村民权益的重要议题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、合法收取宅基费的情形
经过民主议定程序与符合规定：
- 根据《村民委员会组织法》，涉及村民利益的重大事项，如宅基地费的收取，必须经过村民会议或村民代表会议的讨论决定。若村委会在收取宅基费前，已经过这样的民主议定程序，并且所收费用明确用于本村公共设施建设、宅基地规划整理等合理用途，同时收费标准、用途等均符合相关政策和法律规定，那么这样的收费行为是合法的。
依据地方规定收费：
- 不同地区可能根据当地实际情况，制定了关于宅基地管理的具体办法。在这些办法中，可能允许村委会在一定范围内收取相关费用。若村委会是按照这些地方规定进行收费，并且严格履行了相关程序，如公示收费标准、说明收费用途等，那么这样的收费行为也是合法的。
因历史原因或特殊管理需要：
- 对于因历史遗留问题未办理相关手续的宅基地，或因特定管理需要进行规范而收取的费用，如果经过法定程序批准，明确了收费依据、标准和用途，并向村民进行了公示和说明，那么这样的收费行为在特定情境下也可能是合法的。
宅基地面积超标或存在违规行为：
- 若村民的宅基地面积超过了当地政府规定的标准，或存在一户多宅、改变土地性质等违规行为，村委会根据相关政策对超出部分或违规行为进行收费，这也是一种合法的收费情形。
二、不合法收取宅基费的情形
无依据擅自收费：
- 如果村委会没有任何法律、法规、政策依据，自行决定收取宅基费，或者收费项目和标准未经合法程序制定，那么这样的收费行为是不合法的。
收费用途不合法：
- 即使村委会有收费的依据，但如果所收费用未按规定用于合理用途，而是被私自挪用、侵占，那么这样的收费行为同样是不合法的。
三、村民的权益保护
- 作为村民，如果您对村委会收取宅基费的行为有疑问，有权要求村委会出示收费的依据和相关审批文件。同时，您也可以向当地的乡镇政府、国土资源部门等咨询了解相关情况。
- 如果您发现存在违法收费情况，可以通过合法途径维护自己的权益。比如，向有关部门投诉举报，或者寻求法律援助提起诉讼。
综上所述，农村基层组织收取宅基费的合法性取决于多个因素，包括是否经过法定程序、是否有明确的法律依据或地方规定、收费用途是否合理等。作为村民，您应密切关注村委会的收费行为，确保自身合法权益不受侵犯。