宅基地超标交了使用费后，超出的部分并不能直接变得合法。罚款或使用费只是对违反宅基地面积规定这一违法行为的一种处罚措施，它并不能改变超面积部分的违法性质。以下是对这一问题的详细分析：

一、宅基地面积规定的法律背景

农村宅基地的面积是有严格标准和规定的，通常根据家庭人口数量来确定，并遵循“一户一宅”的原则。这是为了保障农村土地资源的合理利用和农民的居住权益。如果建造的房屋超出了规定的宅基地面积标准，那么超出的部分即被视为违法建筑，可能会面临拆除、罚款等处罚措施。

二、缴纳使用费的性质

缴纳使用费（或罚款）是对违反宅基地面积规定的一种常见处罚方式。然而，重要的是要明确，使用费或罚款并不等同于使超面积的状态合法化。换句话说，缴纳使用费只是对违规行为的一种惩处，它并不能直接赋予超面积部分与合法标准面积部分相同的法律地位。

三、超面积部分的处理方式

在实际操作中，各地对于宅基地超面积部分的处理方式可能有所不同。一些地区在符合特定条件下，如符合村庄规划、不妨碍公共利益等，可能会允许超面积部分在一定程度上维持现状使用。但这并不意味着该超面积部分获得了完全合法的属性，因为在后续的房屋翻建、继承等情况时，仍可能需要按照规定进行调整或整改。

另一些地方则可能要求，在条件允许时，比如重新规划宅基地、房屋重建等情况下，必须对超面积部分进行整改，以确保其符合规定标准。这表明，无论何种情况，超面积部分都需要经过相应的处理才能逐步接近或达到合法状态。

四、合法与不合法收费的情形

1. 合法收费情形：

   • 地方政府为了加强宅基地管理、合理利用土地资源，有权出台相关政策对超出规定面积的宅基地进行收费。但前提是这些政策需经过合法程序制定，符合上位法规定，并充分考虑当地农村的实际情况和农民的承受能力。
   • 在过去宅基地管理不规范时期，由于历史原因导致的宅基地面积超出标准的情况，地方政府可基于尊重历史、照顾现实的原则，通过合法程序制定相关收费政策。

2. 不合法收费情形：

   • 如果地方政府或相关部门在无任何法律法规或合法政策依据的情况下，对宅基地超出面积进行收费，该行为是不合法的。农民有权拒绝缴纳此类不合理费用，并可通过法律途径维护自身权益。
   • 即使存在相关政策规定可以对宅基地超出面积收费，但若收费过程中未遵循法定程序（如未提前公示收费标准、收费依据和方式，或存在乱收费、强制收费等行为），也属于违法行为。

五、建议与风险提示

1. 严格遵守规定：建议在建房时一定要严格遵守当地的宅基地面积标准和相关规定，以避免因超出面积而带来的不必要的麻烦和损失。
2. 咨询与了解：如果已经出现了超出面积的情况，应尽快咨询当地的相关部门（如土地管理部门），了解具体的处理方式和规定，以便妥善解决问题并尽可能减少潜在的法律风险。
3. 谨慎对待收费：在面对宅基地超出面积收费时，要仔细甄别收费的合法性和合理性，避免被不合法或不合理收费所侵害。

总之，宅基地超标交了使用费后，超出的部分并不能直接变得合法。农民在处理宅基地问题时，应充分了解相关法律法规和政策规定，确保自身权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。