宅基地超占收费是否合法，主要取决于当地的法律法规和政策规定。以下从合法与不合法两种情形进行详细分析：
合法收费情形
依据地方规定合理收费：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》，农村村民一户只能拥有一处宅基地，且其面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。地方政府为了加强宅基地管理、合理利用土地资源，有权出台相关政策对超出规定面积的宅基地进行收费。这些政策需经过合法程序制定，符合上位法规定，并充分考虑当地农村的实际情况和农民的承受能力。
- 实例说明：如某省规定宅基地面积标准为200平方米，农户实际占用250平方米，则当地政府可依据合法政策对超出的50平方米进行收费。
历史遗留问题妥善处理收费：
- 在过去宅基地管理不规范时期，由于历史原因导致的宅基地面积超出标准的情况，地方政府可基于尊重历史、照顾现实的原则，通过合法程序制定相关收费政策。这种收费旨在逐步规范宅基地使用秩序，同时保障农民的既得利益。
合法程序与公开透明：
- 即使存在上述合法收费的情况，也必须经过合法的审批程序，如召开村民会议或村民代表会议进行民主讨论和表决，并将收费标准、用途等事项进行公示。只有确保程序的合法性和透明度，才能保障村民的合法权益不受侵害。
不合法收费情形
无法律政策依据收费：
- 如果地方政府或相关部门在无任何法律法规或合法政策依据的情况下，对宅基地超出面积进行收费，该行为是不合法的。农民有权拒绝缴纳此类不合理费用，并可通过法律途径维护自身权益。
- 实例说明：如某村村委会在无上级政府相关政策文件支持的情况下自行决定收费，则该收费行为缺乏合法性。
违反法定程序收费：
- 即使存在相关政策规定可以对宅基地超出面积收费，但若收费过程中未遵循法定程序（如未提前公示收费标准、收费依据和方式，或存在乱收费、强制收费等行为），也属于违法行为。农民遇此情况可向相关部门反映，要求纠正违法收费行为，并追究相关人员责任。
收费标准过高或不透明：
- 如果收费标准过高或未做到公开透明，也可能构成不合法收费。这可能损害村民的合法权益，引发社会不公和矛盾。
一般处理原则与建议
- 对于宅基地超出面积的问题，处理方式可能包括罚款、超占部分的有偿使用、拆除超出部分的建筑等，具体以地方政府规定为准。
- 建议：面临此类情况的农民应先了解当地的法律法规和政策规定，以便做出正确决策。同时，关注收费程序是否合法、透明，确保自身权益不受侵害。如有需要，可直接向我咨询，以获取最准确的信息和建议。
综上所述，宅基地超出面积是否收费取决于当地的法律和政策规定。在处理相关问题时，应充分了解相关法律法规和政策依据，确保自身权益不受侵害。