当合同工资与实际发放的工资存在不一致时，关于补偿的计算问题，这确实是一个涉及劳动者权益的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、补偿计算的基础
在大多数情况下，如果合同工资与实际发放的工资不符，补偿的计算会倾向于以实际发放的工资为基础。这是因为实际发放的工资更真实地反映了劳动者在用人单位的实际收入情况。实际工资的计算应涵盖所有货币性收入，包括但不限于基本工资、奖金、津贴等。
二、不同情况下的补偿规则
用人单位少发工资：
- 如果用人单位未按照合同约定足额支付工资，劳动者有权要求用人单位补足差额。
- 此外，根据《劳动合同法》的规定，劳动者还可以解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。经济补偿的标准是按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
- 如果用人单位支付的工资低于当地最低工资标准，除补足差额外，还需按应付金额的50%至100%加付赔偿金。
用人单位多发工资：
- 如果实际发放的工资高于合同工资，且这种差异并非劳动者与用人单位之间的约定或承诺，那么劳动者可能构成不当得利。在这种情况下，用人单位有权要求劳动者返还多发的部分。如果劳动者拒绝返还，用人单位可以通过法律途径追讨。
争议认定工资标准：
- 当双方对工资标准存在争议时，劳动者需要提供证据来证明自己的实际工资水平。这些证据可以包括工资条、银行工资流水、考勤记录、同事证言等。
- 如果劳动者无法证明实际工资高于合同工资，那么在争议解决过程中，可能会按照合同约定的工资作为补偿的计算依据。
三、争议解决途径
- 协商解决：首先，我建议您与用人单位进行协商，尝试通过友好沟通解决工资不符的问题。
- 投诉或仲裁：如果协商不成，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁时，请确保提供充分的证据来支持您的主张。
- 法律诉讼：如果您对仲裁结果不满意，还可以选择向法院提起诉讼，通过司法程序来维护自己的合法权益。
四、重要注意事项
- 在处理此类问题时，请务必妥善保存所有与工资相关的证据，如工资条、银行流水、劳动合同等。这些证据将在争议解决过程中发挥关键作用。
- 同时，我也建议您及时了解并遵守相关的法律法规，如《中华人民共和国劳动合同法》等，以确保自己的行为合法合规。
综上所述，当合同工资与实际发放的工资不符时，补偿的计算会倾向于以实际发放的工资为基础。但具体的情况还需要根据相关的法律法规和实际情况来判断。如果您对此有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询专业的法律人士或劳动监察部门。