结论：加盟商违法时，是否可以起诉总部取决于具体情况，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合同关系角度
合同条款的约定：
- 首先，需要审查加盟合同中的具体条款。如果合同中明确规定了加盟商违法时总部的责任或义务，以及加盟商在此情况下的权利，那么应当按照合同约定来处理。
- 例如，如果合同中约定了总部对加盟商有培训、监督等义务，而总部未履行这些义务导致加盟商违法，那么加盟商可能有权依据合同起诉总部要求承担相应责任。
合同违约的认定：
- 如果加盟商认为总部存在违约行为（如未提供约定的支持、服务或违反了合同中的其他条款），且这种违约行为与加盟商的违法行为之间存在因果关系，那么加盟商可以起诉总部要求赔偿损失或履行合同义务。
- 但需要注意的是，加盟商自身违法行为的责任通常不能直接转嫁给总部，除非总部存在明显的过错或故意行为。
二、法律责任角度
直接责任与间接责任：
- 加盟商作为独立的法律主体，通常对其自身的违法行为承担直接责任。总部一般不对加盟商的违法行为承担直接责任，除非总部存在教唆、帮助或共同实施违法行为的情况。
- 如果总部的行为（如提供虚假信息、误导加盟商等）间接导致了加盟商的违法行为，那么总部可能需要根据其过错程度承担相应的间接责任。
侵权责任：
- 如果总部的行为侵犯了加盟商的合法权益（如名誉权、财产权等），且这种侵权行为与加盟商的违法行为无直接关联，那么加盟商可以依据侵权责任法起诉总部要求赔偿损失。
三、实际操作建议
收集证据：
- 加盟商在考虑起诉总部前，应首先收集相关证据，包括合同文本、沟通记录、交易凭证等，以证明总部的过错或违约行为。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但为保持回答完整性仍提及，实际回答中可侧重于“向我咨询”）：
- 由于合同纠纷和经济纠纷涉及复杂的法律问题和证据规则，建议加盟商在起诉前咨询专业律师，以评估案件的胜诉可能性和法律风险。当然，如果你有相关问题，也可以直接向我咨询。
考虑和解或调解：
- 在起诉前，加盟商也可以考虑与总部进行和解或调解，以达成双方都能接受的解决方案，避免不必要的法律纠纷和成本支出。
总结：加盟商违法时是否可以起诉总部，取决于合同条款的约定、法律责任的认定以及实际操作中的具体情况。建议加盟商在考虑起诉前，先收集相关证据并咨询专业律师，以评估案件的可行性和法律风险。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。