结论：私企老板在留置期间扣押手机，并不意味着所有打来的电话都会被查，这主要取决于留置的具体原因、调查机关的调查需求以及相关法律法规的规定。

分析说明：

1. 留置的性质与目的：

   • 留置通常是一种强制措施，用于对涉嫌违法犯罪的人员进行调查和审讯。其目的在于确保调查的顺利进行，防止嫌疑人逃避或干扰调查。
   • 在留置期间，调查机关可能会根据调查需要，对嫌疑人的通讯工具进行扣押和检查，以获取相关证据或线索。

2. 电话是否会被查的考量因素：

   • 调查需求：调查机关会根据案件的具体情况和调查需求，决定是否对扣押的手机进行通讯记录检查。如果电话内容与案件无关，或者调查机关认为没有必要检查，那么这些电话可能不会被查。
   • 法律法规：调查机关在检查通讯记录时，必须遵守相关法律法规的规定，如保护公民的隐私权等。如果检查行为违反了法律法规，那么相关证据可能会被排除。
   • 技术手段：即使调查机关决定检查通讯记录，也需要具备相应的技术手段和能力。如果技术条件不足或检查难度较大，那么部分电话可能无法被有效检查。

3. 实际操作中的情况：

   • 在实际操作中，调查机关通常会根据案件的重要性和紧急程度，以及嫌疑人的涉嫌罪名等因素，来决定检查的力度和范围。
   • 对于一些重大、复杂的案件，调查机关可能会对嫌疑人的所有通讯记录进行全面检查，以获取尽可能多的证据和线索。
   • 而对于一些轻微、简单的案件，调查机关可能只会对部分关键通讯记录进行检查，或者根本不进行检查。

法律建议：

• 保护个人隐私：虽然留置期间调查机关有权对嫌疑人的通讯工具进行检查，但嫌疑人也享有个人隐私权。如果调查机关的检查行为违反了法律法规或侵犯了个人隐私权，嫌疑人可以依法维权。
• 配合调查：在留置期间，嫌疑人应积极配合调查机关的调查工作，如实提供相关信息和证据。这有助于加快调查进程，减少不必要的麻烦和损失。
• 咨询专业律师：如果嫌疑人对留置期间的通讯检查有疑问或担忧，可以及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及如何应对可能的法律风险。

后续行动建议：

• 如果您或您身边的人遇到了类似情况，建议保持冷静，不要惊慌失措。
• 及时了解留置的具体原因和调查机关的调查需求，以便更好地应对和配合调查。
• 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。

如有任何进一步的问题或需要法律帮助，请随时向我咨询。