结论：事业单位工作人员在检察院不起诉的情况下，一般不会被开除公职，但具体还需根据不起诉的原因、犯罪性质及单位规章制度等因素综合判断。

分析说明：

1. 不起诉的法律含义：

   • 不起诉是检察院对案件审查后，认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪，或者依法不应追究刑事责任，或者犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，而作出的终止诉讼的决定。

2. 不起诉与开除公职的关系：

   • 根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》的相关规定，公职人员因犯罪被单处罚金，或者犯罪情节轻微，人民检察院依法作出不起诉决定或者人民法院依法免予刑事处罚的，予以撤职；造成不良影响的，予以开除。
   • 这意味着，在不起诉的情况下，事业单位工作人员一般不会被直接开除公职，但可能会受到撤职等政务处分。如果不起诉决定是因为犯罪情节轻微且未造成不良影响，那么撤职处分可能是主要的处理方式。

3. 其他影响因素：

   • 犯罪性质：如果涉及的犯罪性质严重，即使检察院不起诉，单位也可能根据内部规章制度或上级指示，对工作人员进行更严厉的处分，包括开除公职。但这种情况较为少见，且需要明确的依据。
   • 单位规章制度：不同的事业单位可能有不同的规章制度，对工作人员的违纪违法行为有不同的处理标准。因此，在不起诉的情况下，单位的具体处理方式还需参考其内部规章制度。

特殊场景：

• 如果事业单位工作人员因犯罪被检察院提起公诉，但最终法院判决免予刑事处罚或单处罚金，且该犯罪行为造成了不良影响，那么根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》的规定，该工作人员可能会被开除公职。
• 另外，如果不起诉决定是基于证据不足或程序问题等非实体性原因作出的，而后续有新证据出现或程序问题得到纠正，导致案件重新进入诉讼程序并最终被定罪，那么该工作人员仍可能面临开除公职的风险。

建议与行动：

• 对于事业单位工作人员而言，应严格遵守法律法规和单位规章制度，避免任何违法违纪行为的发生。
• 如果因某种原因面临检察院的不起诉决定，建议及时与单位沟通，了解单位的具体处理方式和要求，以便做好相应的准备和应对。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和指导。