抵押权在抵押人明知房产是诈骗所得的情况下，一般会被认定为无效。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律背景与原则
善意取得原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，抵押权的设立应当遵循善意取得原则。这意味着，抵押权人在取得抵押权时，应当是善意的，即不知道或不应知道抵押物存在权利瑕疵。
- 在本案例中，抵押人明知房产是诈骗所得，却仍然取得房产证并办理抵押贷款，这明显违反了善意取得原则。
非法所得不受保护：
- 诈骗所得的房产属于非法所得，根据法律规定，非法所得不受法律保护。因此，基于非法所得设立的抵押权，其合法性也受到质疑。
二、抵押权无效的具体情形
抵押人恶意：
- 抵押人明知房产是诈骗所得，却故意隐瞒真相，以欺骗手段取得房产证并办理抵押贷款。这种恶意行为直接导致抵押权的设立缺乏合法基础。
抵押权人非善意：
- 如果抵押权人在接受抵押时，知道或应当知道房产存在权利瑕疵（如诈骗所得），那么其抵押权也将受到质疑。然而，在本案例中，虽然主要焦点是抵押人的恶意，但抵押权人的善意与否也是影响抵押权有效性的一个因素。不过，由于抵押人的恶意行为已经足够导致抵押权无效，因此即使抵押权人善意，也可能因抵押人的恶意而受到影响。
法律程序瑕疵：
- 诈骗所得的房产在办理房产证和抵押贷款过程中，可能存在法律程序上的瑕疵。例如，房产证的取得可能基于虚假材料或非法手段，这也会导致抵押权的设立存在法律障碍。
三、法律后果与建议
抵押权无效：
- 在抵押人明知房产是诈骗所得的情况下，抵押权一般会被认定为无效。这意味着，抵押权人无法依据抵押权对房产进行处置或优先受偿。
法律责任：
- 抵押人可能因诈骗行为而承担刑事责任，同时还需要承担因抵押权无效而给抵押权人造成的损失赔偿责任。
建议：
- 对于抵押权人而言，在接受抵押时，应严格审查抵押物的来源和合法性，确保抵押权的设立符合法律规定。
- 对于抵押人而言，应遵守法律法规，不得以非法所得设立抵押权，否则将承担严重的法律后果。
- 如果您或他人遇到类似情况，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身合法权益。
综上所述，抵押权在抵押人明知房产是诈骗所得的情况下，一般会被认定为无效。这既符合法律原则，也体现了对非法所得的打击和保护合法债权人的立场。