在刑事案件中，轻伤二级且法院让协商调解的情况下，确实存在不起诉的可能性，但并非绝对。以下从多个角度为你详细分析：
一、不起诉的法律依据与条件
法定不起诉情形：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。
- 在轻伤二级的案件中，如果符合上述法定不起诉的情形，如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的，那么检察院可以作出不起诉决定。
酌定不起诉情形：
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出不起诉决定。在轻伤二级的案件中，如果犯罪嫌疑人认罪态度好，积极赔偿被害人损失并取得谅解，且犯罪情节轻微，那么检察院有可能考虑酌定不起诉。
二、协商调解在不起诉决定中的作用
协商调解的意义：
- 协商调解是刑事案件处理中的一种重要方式，它有助于化解矛盾、修复社会关系，并减轻司法机关的负担。在轻伤二级的案件中，如果双方当事人能够达成和解，那么这往往成为检察院考虑不起诉的重要因素之一。
协商调解对不起诉决定的影响：
- 如果双方当事人通过协商调解达成了和解协议，并且犯罪嫌疑人积极履行了赔偿义务，取得了被害人的谅解，那么检察院在审查案件时，会充分考虑这些因素，并有可能作出不起诉决定。但需要注意的是，协商调解并不是不起诉的唯一条件，检察院还会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、社会危害性等因素。
三、不起诉决定的程序与后续影响
不起诉决定的程序：
- 检察院在审查案件后，如果认为符合不起诉的条件，会作出不起诉决定，并将不起诉决定书送达犯罪嫌疑人和被害人。犯罪嫌疑人如果对不起诉决定不服，可以向检察院申诉；被害人如果对不起诉决定不服，可以向上一级检察院申诉，或者直接向法院起诉。
不起诉决定的后续影响：
- 如果检察院作出不起诉决定，那么犯罪嫌疑人将不会被追究刑事责任。但是，这并不意味着犯罪嫌疑人可以完全摆脱法律后果。例如，如果犯罪嫌疑人的行为违反了治安管理处罚法，那么公安机关仍然可以对其进行行政处罚。此外，不起诉决定也可能对犯罪嫌疑人的社会声誉、职业发展等产生一定影响。
四、建议与注意事项
积极配合协商调解：
- 如果犯罪嫌疑人希望获得不起诉的机会，那么应该积极配合协商调解工作，与被害人进行坦诚沟通，争取达成和解协议。
寻求专业法律帮助：
- 在处理刑事案件时，寻求专业律师的帮助是非常重要的。律师可以为犯罪嫌疑人提供法律咨询、代理申诉、参与协商调解等服务，帮助犯罪嫌疑人更好地维护自己的合法权益。
注意法律后果与风险：
- 犯罪嫌疑人应该充分了解不起诉决定的法律后果与风险，包括可能面临的行政处罚、社会声誉影响等。在做出决策时，应该综合考虑各种因素，做出明智的选择。
总结来说，轻伤二级且法院让协商调解的情况下，存在不起诉的可能性，但具体是否不起诉还需由检察院根据案件情况综合判断。如果你或你身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。