责令候查申请是否需要书面回复，这主要取决于具体的法律规定以及相关部门的操作规范，但通常情况下，责令候查申请应当有明确的书面回复。以下从几个方面进行详细分析：

1. 法律原则与程序要求：

   • 在法律程序中，书面回复是一种正式且具有法律效力的沟通方式。它能够确保信息的准确传递，避免口头沟通可能带来的误解或遗漏。
   • 责令候查作为一种法律措施，其申请和回复都应当遵循严格的法律程序。书面回复可以明确记录申请的内容、回复的意见以及相关的法律依据，为后续的法律程序提供有力的证据支持。

2. 实际操作中的规范：

   • 在实际操作中，相关部门（如公安机关、检察机关等）通常会制定具体的操作规范，明确责令候查申请的提交、审查、回复等流程。
   • 这些规范往往要求以书面形式进行回复，以确保程序的规范性和严肃性。书面回复可以包括决定书、通知书等形式，明确告知申请人责令候查的决定、理由以及后续的法律程序。

3. 申请人的权益保障：

   • 对于申请人而言，书面回复是其了解申请结果、维护自身权益的重要依据。如果相关部门仅以口头方式回复，申请人可能难以证明其申请已被受理或处理，从而在后续的法律程序中处于不利地位。
   • 书面回复还可以为申请人提供申诉或复议的依据。如果申请人对责令候查的决定有异议，他可以根据书面回复中的内容和法律依据，向相关部门提出申诉或复议申请。

4. 特殊情况下的处理：

   • 当然，也存在一些特殊情况，如紧急情况下可能无法立即提供书面回复。但即便如此，相关部门也应当在事后尽快补发书面回复，以确保程序的完整性和合法性。
   • 另外，如果申请人明确同意或要求以口头方式回复，且相关部门认为口头回复不会损害申请人的权益或影响程序的公正性，那么也可以考虑以口头方式回复。但这种情况应当非常谨慎处理，并确保有充分的记录和证据支持。

建议：

• 如果您作为申请人提交了责令候查申请，建议您主动要求相关部门提供书面回复，以确保您的权益得到充分保障。
• 如果您对责令候查的决定有异议或需要进一步的法律帮助，请及时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。