针对“三个人入住只登记两个人处罚谁”的问题，这主要取决于具体的法律法规以及入住场所的管理规定，以下从几个常见角度进行分析：

1. 从旅馆业管理规定角度：

   • 根据《旅馆业治安管理办法》等相关规定，旅馆应当如实登记旅客的身份证件信息，包括姓名、性别、年龄、住址等，并确保一人一证，实名登记。这是为了维护旅馆业的治安秩序，保障旅客的安全。
   • 如果三个人入住但只登记了两个人，旅馆可能因未履行实名登记义务而面临行政处罚，如罚款、停业整顿等。至于具体处罚谁，通常是旅馆的经营者或管理者，因为他们是直接负责登记工作的人员。

2. 从入住旅客角度：

   • 旅客作为入住方，也有义务配合旅馆进行实名登记。如果旅客故意隐瞒或拒绝提供真实身份信息，虽然直接的法律责任可能由旅馆承担，但旅客也可能因违反相关规定而面临一定的法律后果，如被拒绝入住、被要求离开旅馆等。不过，在大多数情况下，旅客不会因未登记而直接受到行政处罚，除非其行为涉及其他违法犯罪活动。

3. 从实际操作与责任划分角度：

   • 在实际操作中，如果旅馆发现未登记的情况，通常会要求旅客补登或采取其他措施。如果旅馆未采取任何措施，且被公安机关查处，那么旅馆将承担主要责任。
   • 如果旅客拒绝补登或提供虚假信息，旅馆可以拒绝其入住或要求其离开，并有权向公安机关报告。在这种情况下，旅客可能因违反旅馆规定或相关法律法规而面临相应的处理。

建议与总结：

• 对于旅馆而言，应严格遵守实名登记制度，确保每位旅客的信息都得到准确登记，以避免不必要的法律风险和行政处罚。
• 对于旅客而言，应积极配合旅馆的登记工作，提供真实有效的身份信息，以维护自身的合法权益和旅馆的治安秩序。
• 如果遇到相关问题或纠纷，建议及时咨询专业律师或相关机构，以获取更具体的法律建议和帮助。

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